Project detail

The use of combination of laser microbeam and cytometric techniques in the study of the structure and dynamics of human genome

Duration: 01.01.2002 — 31.12.2006

Funding resources

Technologická agentura ČR - 1. veřejná soutěž Program podpory aplikovaného výzkumu, experimentálního vývoje a inovací DELTA 2 2019

- part funder (2002-01-01 - 2006-12-31)

On the project

Podstatou projektu je využít metod a experimentálních sestav optické pinzety, optického skalpelu a automatizovaného cytometru, které byly vyvinuty za finanční podpory předcházejících projektů, ke studiu mechanických vlastností a uspořádání interfázního c hromatinu v jádrech živých i fixovaných lidských buněk. Teoretické a experimentální zkušenosti interdisciplinárního týmu řešitelů budou využity: - k fluorescenčnímu barvení chromatinu živých buněk, - k laserem indukované fúzi živých fluorescenčně označen ých buněk, - k topologické analýze rozložení obarvené oblasti chromatinu v jádrech živých a fixovaných buněk, - ke vnášení fluorescenčně obarvených nanosond do jádra živé buňky, optickému zachycení sondy a vymezení prostoru, který je pro sondu nedostupný , s mikrometrovým rozlišením, - ke studiu mechanických vlastností chromatinu s využitím optických manipulací s vhodnými sondami. Získané poznatky budou využity pro vývoj nových diagnostických metod

Description in English
The aim of the project is to use the methods and experimental systems of optical tweezers, optical scalpel, and automated cytometer, that were developed using the finantial support of the previous scientific projects, for the study of the mechanical properties and arrangement of the interphase chromatin in the nuclei of living and fixed human cells. Theoretical and experimental experiences of the interdisciplinary team of applicants will be used for: - fluorescence labelling of chromatin in living cells, - laser induced fusion of labelled cells, - topologic analyses of the dye distribution inside living and fixed cells, - insertion of dyed nanoparticle into the living cell nucleus, optical confinement of this probe and detection of the region which is not accesible for the probe, - study of the mechanical properties of the chromatin using optical trapping of suitable probes. The knowledge obtained by these techniques will be used for development of new diagnostic methods.

Keywords
optická pinzeta, optický skalpel, cytometr s vysokým rozlišením, konfokální mikroskop, struktura chromatinu, nukleární struktura, chromozomy, lidský genom, genomika,diagnostika v onkologii, fúze buněk, obrazová analýza

Key words in English
optical-tweezers; optical-scalpel; high-resolution-cytometer; confocal- microscopy; chromatin-structure; nuclear-structure; chromosome-domains; chromosome-aberrations; human-genome; genomics; diagnostics-in-oncology; cell-fusion; image-analyses

Mark

IAA1065203

Default language

Czech

People responsible

Liška Miroslav, prof. RNDr., DrSc. - principal person responsible

Units

Institute of Physical Engineering
- beneficiary (2002-01-01 - 2006-12-31)

Results

KOLMAN, P.; CHMELÍK, R.; LOVICAR, L.; SUCHOMEL, F. Low-coherence interference microscope in transmission mode. In Focus on Microscopy 2005 - Jena, Germany. March 20-23, 2005. Appendix to the abstract book. Jena, Germany: 2005. p. 60-60.
Detail

CHMELÍK, R., KOLMAN, P. Transmisní holografický mikroskop pro polychromatické světlo: návrh optické soustavy a vlastnosti zobrazení. Jemná mechanika a optika, 2004, roč. 49, č. 9, s. 248 ( s.)ISSN: 0447-6441.
Detail

PROKOPOVÁ, M. Transmisní holografická konfokální mikroskopie. Jemná mechanika a optika, 2003, roč. 48, č. 6, s. 166 ( s.)ISSN: 0447-6441.
Detail

CHMELÍK, R., HARNA, Z., LOVICAR, L., ANTOŠOVÁ, I. Měření povrchů holografickým konfokálním mikroskopem. Jemná mechanika a optika, 2003, roč. 48, č. 6, s. 174 ( s.)ISSN: 0447-6441.
Detail

CHMELÍK, R.; KOLMAN, P.: THM Pecka; Digitální holografický mikroskop pro procházejcí světlo s nízkou koherencí. A2/212. (funkční vzorek)
Detail