Projekt se zabývá zlepšením kvality a využitelnosti nanotomografických dat přístroje Nano3DX pro účely nedestruktivní analýzy biologických vzorků. Záměrem projektu je vývoj funkčního vzorku držáku biologických vzorků pro tento přístroj. Nedílnou součástí je výzkum a exp. stanovení parametrů tomografických měření, zvýšení kontrastu vzorků barvícími metodami a fázovým kontrastem. Dále budou vytvořeny segmentační a klasifikační algoritmy umožňující analýzu a hodnocení kvality naměřených dat.

Description in English
Objective of this project is to increase quality of nanotomographic measurement of biological samples and degradable materials with the use of Nano3DX to enable higher applicabillity of acquired data. During the project parametres of measument in phase contrast will be optimized for various biological samples and method for staining to increase contrast of individual tissues will be developed. This will result in comprehensive methodology and protocol for staining. Main objection as well as output in functional sample holder compatible with electron microscope SEM, which data are used as reference to tomografic measurement. Important will be also development of modules to software of RITE company containing segmentation and classification algorithms for automatic analysis of measured data.

Keywords
Rentgenová počítačová nano tomografie; barvení vzorku; kyselina fosfowolframová (PTA); barvení jódem; barvení osmiem; fázový kontrast; segmentace obrazu; klasifikace obrazu; měkké tkáně; biodegradabilní materiály;

Key words in English
X-ray computed nano tomography, sample stainig, Phosphotungstic acid (PTA), iodine staining, osmium staining, phase contrasts, image segmentation, image classification, soft tissues, biodegradable materials