Přístupnostní navigace
E-application
Search Search Close
Publication detail
JUGAS, R.
Original Title
Číslicové zpracování genomických signálů pro klasifikaci rostlin
English Title
Digital Signal Processing for Genome Classification of Plants
Type
conference paper
Language
Czech
Original Abstract
Numerické reprezentace DNA sekvence prošly v posledních několika letech výrazným rozvojem. Existuje větší množství technik, které produkují signály s různými vlastnostmi. V této práci prezentujeme konstrukci dendrogramů pro tři různé signálové reprezentace a srovnání těchto dendrogramů s metodou založenou na vícenásobném znakovém zarovnání. Klasifikace signal je provedena jako shluková analýzay založená na Euklidovské metrice vzdáleností všech dvojic signal zarovnaných pomocí dynamického borcení časové osy.
English abstract
Numerical representations of DNA sequence underwent a significant development during last few years. Nevertheless, there are several techniques producing signals with various features. In this work, we present dendrogram construction for three different signal representations and its comparison with standard method based on multiple alignment of character sequences. Signal classification is performed as a cluster analysis using Euclidian metrics measuring pairwise distance between all pairs of signals aligned using dynamic time warping.
Keywords
klasifikace, DNA signál, dtw
Key words in English
classification, DNA signal, dtw
Authors
RIV year
2014
Released
24. 4. 2014
Publisher
LITERA
Location
Brno
ISBN
978-80-214-4922-0
Book
Proceedings of the 20th conference Student EEICT 2014
Edition number
1.
Pages from
132
Pages to
134
Pages count
3
BibTex
@inproceedings{BUT107381, author="Robin {Jugas}", title="Číslicové zpracování genomických signálů pro klasifikaci rostlin", booktitle="Proceedings of the 20th conference Student EEICT 2014", year="2014", number="1.", pages="132--134", publisher="LITERA", address="Brno", isbn="978-80-214-4922-0" }