Publication detail

Využití magnetických částic při izolaci DNA z rybízových džemů

Hronová Aneta, Kovařík Aleš, Španová Alena, Rittich Bohuslav

Original Title

Využití magnetických částic při izolaci DNA z rybízových džemů

English Title

Application of magnetic particles for DNA isolation from currant jams

Type

abstract

Language

Czech

Original Abstract

Práce byla zaměřena na testování mikroizolace DNA za pomocí magnetických částic z tepelně zpracovaných potravinových výrobků v kvalitě vhodné pro PCR. Pro analýzu byly použity rybízové džemy. Ty byly homogenizovány s použitím plastového kopistu a stomacheru v lyzačním roztoku s CTAB. Při přípravě homogenátů byl testován vliv chloroform-oktanolu a isopropanolu. Homogenáty byly použity pro izolaci DNA magnetickými částicemi. Byly testovány dva druhy magnetických částic: mikročástice P(HEMA-co-GMA) a nanočástice oxidů železa pokryté poly(L-lysinem) – PLL. Kvantita a kvalita izolované DNA byla stanovena spektrofotometricky. Poté byla testována amplifikovatelnost DNA v PCR. Pro amplifikaci byly použity primery specifické pro rostlinnou ribosomální DNA. Produkty PCR s očekávanou délkou 700 bp byly detegovány agarózovou gelovou elektroforézou. Bylo zjištěno, že z džemů lze pomocí testovaných magnetických nosičů izolovat DNA v kvalitě vhodné pro PCR.

English abstract

The work has been focused on testing of micromethod of DNA isolation using magnetic particles from thermic-managed food products in a quality suitable for PCR. Currant jams were selected for the analysis. These were homogenized using plastic copist and stomacher in lysis buffer with cetyltrimethylammonium bromide (CTAB). The effect of chloroform-octanol and isopropanol in the preparation of homogenates was tested. Homogenates were used for DNA isolation by magnetic particles. Two types of magnetic particles were tested: microparticles of P(HEMA-co-GMA) and nanoparticles of iron oxides covered by poly(L-lysine) – PLL. The concentration and quality of isolated DNA was verified by UV spectrophotometry. Amplification of the DNA was tested in PCR. Primers specific for plant ribosomal DNA were used. PCR products of expected length 700 bp were detected by agarose gel electrophoresis. It was shown that DNA isolated from currant jams using magnetic particles was in PCR-ready quality.

Keywords

izolace DNA, magnetické mikročástice, magnetické nanočástice, PCR

Key words in English

isolation of DNA, magnetic microparticles, magnetic nanoparticles, PCR

Authors

Hronová Aneta, Kovařík Aleš, Španová Alena, Rittich Bohuslav

Released

23. 3. 2017

Publisher

VUT v Brně, Fakulta chemická, Purkyňova 464/118 612 00 Brno

Location

Brno

ISBN

FCH-S-17-4695

Book

Chemie je život 2017

Edition number

1

Pages from

31

Pages to

31

Pages count

1

BibTex

@misc{BUT145830,
  author="Aneta {Hronová} and Aleš {Kovařík} and Alena {Španová} and Bohuslav {Rittich}",
  title="Využití magnetických částic při izolaci DNA z rybízových džemů",
  booktitle="Chemie je život 2017",
  year="2017",
  edition="1",
  pages="31--31",
  publisher="VUT v Brně, Fakulta chemická, Purkyňova 464/118 612 00 Brno",
  address="Brno",
  isbn="FCH-S-17-4695",
  note="abstract"
}