Fylogenetická stromová struktura vybraných sub-rodin metallothioneinů

Phylogenetic tree structure of metallothionen sub-family

conference paper

Czech

Metallothioneiny (MT) jsou malé na cysteiny bohaté proteiny, které v organismu zajišťují transport kovů. Přestože byli MT poprvé popsány již roku 1957 všechny jejich možnosti a vlivy na organismus nejsou zatím dostatečně objasněny. Pro zjištění podobnosti molekulární struktury bílkovin jsme využili fylogenetickou analýzu, která zjišťuje evoluční příbuznost organismů. Protože celá veřejná databáze obsahuje přes 1000 záznamů z obrovské rodiny MT zařazených jak do eukaryotických tak prokaryotických organismů, zkonstruovali jsme několik fylogenetických stromů pro určité vybrané taxonomické skupiny MT: bakterie, lidé a rostliny.

Metallothioneins (MTs) are small cysteine-rich proteins that are involved in many diverse biological processes. These multifunction proteins constitute a superfamily. They are found not only in eukaryotes, but also in prokaryotic micro organisms. Although they keep analogical function, their primary structures are often diverse. Phylogenetic analysis reveals similarities and dissimilarities in sequence structures among various subfamilies of MTs.

fylogenetický strom, neigbour-joining, BIONJ, Jukes-Cantor, metallothionein

Metallothionein, phylogenetic, sequence motif, sequence logo, BIONJ

ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R.

2010

20. 4. 2010

Muni Press

Brno

978-80-210-5164-5

XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů

14

77

78

2