Publication detail

Bootstrap consensus tree in phylogeny reconstruction

SEDLÁŘ, K. ŠKUTKOVÁ, H.

Original Title

Bootstrap consensus tree in phylogeny reconstruction

English Title

Bootstrap consensus tree in phylogeny reconstruction

Type

conference paper

Language

Czech

Original Abstract

V posledních desetiletích zaznamenala fylogenetická rekonstrukce obrovský rozvoj spojený s lepší dostupností molekulárních dat. Do budoucna lze předpokládat její ještě masivnější využití způsobené stále rychlejším sekvenováním genomických dat. Současně s tím vyvstává otázka, jakým způsobem bude hodnocena kvalita fylogenetických stromů. Účinným nástrojem pro tuto operaci se jeví bootstrapping. I v rámci této techniky však existují odlišné přístupy a neexistuje jednotný názor na interpretaci hodnot, které nám poskytuje.

English abstract

In recent decades, phylogenetic reconstruction went through huge development coupled with better availability of molecular data. We can expect its wider use in the future due to increasing speed of sequencing of genomic data. At the same time the question how to evaluate the quality of phylogenetic trees raises. Bootstrap appears to be an effective tool for this operation. However there are different approaches in the bootstrap technique and there is no agreement on the interpretation of values it provides.

Keywords

fylogenetika, bootstrapping, konsensuální strom, podpora

Key words in English

phylogenetics, bootstrap, consensus tree, support

Authors

SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.

RIV year

2011

Released

28. 4. 2011

Publisher

VUT v Brně

Location

Brno

ISBN

978-80-214-4271-9

Book

Sborník soutěže Student EEICT 2011

Pages from

130

Pages to

132

Pages count

3

BibTex

@inproceedings{BUT36138,
  author="Karel {Sedlář} and Helena {Vítková}",
  title="Bootstrap consensus tree in phylogeny reconstruction",
  booktitle="Sborník soutěže Student EEICT 2011",
  year="2011",
  pages="130--132",
  publisher="VUT v Brně",
  address="Brno",
  isbn="978-80-214-4271-9"
}