Detail předmětu

Bioanalytické metody

FCH-MC_BIMAk. rok: 2014/2015

Metody analýzy buněk. Izolace nukleových kyselin. Spektrofotometrické hodnocení kvality izolované DNA. Separace nukleových kyselin - elektromigrační a chromatografické metody. Fragmentace molekul DNA restrikčními enzymy. Umělé restrikční systémy. Polymerázová řetězová metoda (PCR). Ostatní amplifikační metody. DNA/DNA hybridizace a DNA sondy. Fluorescenční in situ hybridizace- FISH. Čipy. Chemická syntéza DNA. Sekvencování. Nosiče s imobilizovanými ligandy v molekulární diagnostice. Rozlišení živých a mrtvých buněk. Využití chromatografických metod při identifikaci mikroorganismů. Hodnocení antimikrobiální aktivity látek. Bioinformatika (analýza sekvencí).

Jazyk výuky

čeština

Počet kreditů

4

Garant předmětu

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Zajišťuje ústav

Ústav chemie potravin a biotechnologií (ÚCHPBT)

Výsledky učení předmětu

Teoratické znalosti základů metod analýzy DNA.

Prerekvizity

Na předmět navazuje Praktikum z molekulární biotechnologie.

Plánované vzdělávací činnosti a výukové metody

Výuka předmětu je realizována formou: Přednáška - 2 vyučovací hodiny týdně. Vyučujícím a studentům je k dispozici e-learningový systém LMS Moodle.

Způsob a kritéria hodnocení

Zkouška z předmětu je ústní. Při ústní zkoušce má student prokázat stupeň porozumnění danému předmětu.

Osnovy výuky

1. Metody analýzy buněk. Izolace nukleových kyselin. Spektrofotometrická hodnocení kvality izolované DNA.
2. Separace nukleových kyselin - elektromigrační a chromatografické metody.
3. Fragmentace molekul DNA restrikčními enzymy. Umělé restrikční systémy.
4. Polymerázová řetězová metoda (PCR).
5. Ostatní amplifikační metody.
6. DNA/DNA hybridizace a DNA sondy.
7. Fluorescenční in situ hybridizace - FISH. Čipy.
8. Chemická syntéza DNA.
9. Sekvencování.
10. Nosiče s imobilizovanými ligandy v molekulární diagnostice.
11. Rozlišení živých a mrtvých buněk. Využití chromatografických metod při identifikaci mikroorganismů.
12. Hodnocení antimikrobiální aktivity látek.
13. Bioinformatika (analýza sekvencí).

Učební cíle

Cílem přednášek je seznámit studenty se základními metodami analýzy DNA

Vymezení kontrolované výuky a způsob jejího provádění a formy nahrazování zameškané výuky

Účast na přenáškách není povinná ale doporučuje se.

Zařazení předmětu ve studijních plánech

  • Program NPCP_CHTP magisterský navazující

    obor NPCO_CHTP , 2 ročník, zimní semestr, povinně volitelný

  • Program NKCP_CHTP magisterský navazující

    obor NKCO_CHTP , 2 ročník, zimní semestr, povinně volitelný

  • Program CKCP_CZV celoživotní vzdělávání (není studentem)

    obor CKCO_CZV , 1 ročník, zimní semestr, povinně volitelný

Typ (způsob) výuky

 

Přednáška

26 hod., nepovinná

Vyučující / Lektor

RNDr. Aleš Kovařík, CSc.
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
doc. RNDr. Alena Španová, CSc.