Detail předmětu
Analýza a interpretace biologických dat
FEKT-MABDAk. rok: 2018/2019
Předmět je orientován na nativní a evokované biologické signály (biosignály) člověka. Zaměřuje se na vlastnosti biosignálů generovaných jednotlivými systémy lidského organismu (zejména kardiovaskulárním, nervovým a svalovým) a na jejich způsoby zobrazení. Klade důraz na využití obecných i specifických metod pro předzpracování a analýzu biosignálů v časové a ve frekvenční oblasti.
Jazyk výuky
Počet kreditů
Garant předmětu
Zajišťuje ústav
Výsledky učení předmětu
- formulovat požadavky na filtry pro potlačení rušení v signálech EKG, EEG, EMG
- navrhnout a realizovat adaptivní filtry pro potlačení síťového brumu v biosignálech
- navrhnout a realizovat speciální filtry Lynnova typu pro potlačení úzkopásmového rušení
- vysvětlit princip detekce komplexů QRS v signálech EKG a grafoelementů v signálech EEG
- vysvětlit princip detekce začátků a konců významných vln v signálech EKG
- vysvětlit princip testu stacionarity stochastických signálů
- vysvětlit princip neparametrických metod pro odhady výkonových spekter
- realizovat parametrické metody pro odhady výkonových spekter
- popsat princip odhadu vzájemných a koherenčních spekter a jejich využití pro analýzu signálů EEG
- popsat metody odhadu výkonu ve vybraných frekvenčních pásmech u signálů HRV a EEG
- popsat princip Poincarého map a jejich využití pro analýzu signálů (HRV, TWA)
- vysvětlit princip realizace mapování hodnot a frekvenčního mapování pro analýzu signálů EEG
- vysvětlit princip průběžného odhadu úrovně povrchového signálu EMG
Prerekvizity
Plánované vzdělávací činnosti a výukové metody
Způsob a kritéria hodnocení
- až 70 bodů za zkoušku (ze zkoušky je nutné získat minimálně 35 bodů)
- 30 points can be obtained for activity in the laboratory exercises, consisting in solving tasks (for the procedure for the examination must be obtained at least 15 points)
- 70 points can be obtained for the exam (the examination is necessary to obtain at least 35 points)
Osnovy výuky
2. Elektrokardiogramy (EKG), jejich vlastnosti a způsoby zobrazení. Klidové a zátěžové elektrokardiogramy, způsoby jejich zpracování a vyhodnocení.
3. Potlačení rušení, zejména driftu a brumu lineárními, adaptivními i nelineárními metodami, potlačení myopotenciálů.
4. Metody detekce komplexů QRS. Měření variability srdečního rytmu (HRV), zpracování HRV v časové a frekvenční oblasti.
5. Rozměření významných kmitů a vln v signálech EKG, diagnostické klasifikační systémy. Alternace vlny T (TWA), metody zpracování.
6. Úvod do vlnkových transformací (WT) se souvislým a s diskrétním časem.
7. Využití WT pro filtraci a analýzu biosignálů.
8. FonoKG a jeho zpracování. Signály EGG a jejich zpracování.
9. Signály EMG a jejich vlastnosti. Analýza MUAP, zpracování povrchových signálů (SEMG).
10. Signály EEG a jejich vlastnosti. Zpracování EEG v časové oblasti.
11. Zpracování EEG ve frekvenční oblasti. Principy mapování v časové a ve frekvenční oblasti.
12. Biosignály zrakového systému, Evokovaná aktivita mozku, zrakové a sluchové evokované odpovědi, odpovědi motorického systému.
Učební cíle
Vymezení kontrolované výuky a způsob jejího provádění a formy nahrazování zameškané výuky
Základní literatura
Zařazení předmětu ve studijních plánech
Typ (způsob) výuky
Přednáška
Vyučující / Lektor
Osnova
2. Elektrokardiogramy (EKG), jejich vlastnosti a způsoby zobrazení. Klidové a zátěžové elektrokardiogramy, způsoby jejich zpracování a vyhodnocení.
3. Potlačení rušení, zejména driftu a brumu lineárními, adaptivními i nelineárními metodami, potlačení myopotenciálů.
4. Metody detekce komplexů QRS. Měření variability srdečního rytmu (HRV), zpracování HRV v časové a frekvenční oblasti.
5. Rozměření významných kmitů a vln v signálech EKG, diagnostické klasifikační systémy. Alternace vlny T (TWA), metody zpracování.
6. Úvod do vlnkových transformací (WT) se souvislým a s diskrétním časem.
7. Využití WT pro filtraci a analýzu biosignálů.
8. FonoKG a jeho zpracování. Signály EGG a jejich zpracování.
9. Signály EMG a jejich vlastnosti. Analýza MUAP, zpracování povrchových signálů (SEMG).
10. Signály EEG a jejich vlastnosti. Zpracování EEG v časové oblasti.
11. Zpracování EEG ve frekvenční oblasti. Principy mapování v časové a ve frekvenční oblasti.
12. Biosignály zrakového systému, Evokovaná aktivita mozku, zrakové a sluchové evokované odpovědi, odpovědi motorického systému.
Cvičení na počítači
Vyučující / Lektor
Osnova
2. Návrhy Lynnových filtrů pro potlačení driftu a brumu v signálech EKG
3. Vektorkardiogramy (VKG) a výpočet srdeční osy
4. Návrhy adaptivních filtrů pro potlačení brumu v signálech EKG
5. Návrhy detektorů komplexů QRS
6. Signály variability srdečního rytmu (HRV)
7. Spektrální analýza signálů HRV
8. Detekce grafoelementů v signálech EEG
9. Spektrální analýza signálů EEG, vzájemné a koherenční spektrum
10. Průběžný výpočet Hjorthových parametrů pro analýzu signálů EEG
11. Průběžný odhad úrovně povrchového signálu EMG, Spektrální analýza signálů EMG
12. Vlnkové transformace a jejich využití