čeština

Absolvent předmětu:
- Je schopen organizace vlastní práce směrem k jeho kariernímu postupu
- Umí vyhledávat zdroje a zpracovávat informace poskytnuté mentorem
- Je schopen definovat a řešit problémy šířeji související s tématem jeho dizertace
- Umí využít nabytých vědomostí k vytvoření pomůcek do výuky

Předmět probíhá individuální formou, kdy je každému doktorandovi přidělen odborník na problematiku z širšího okruhu teoretických znalostí a odborných dovedností souvisejících s tématem jeho dizertační práce. Student si dle vlastní potřeby domlouvá konzultace s přiděleným mentorem a současně pracuje vybraných kontrolovatelných výstupech.

Student si sám volí své kontrolovatelné výstupy, za které získá příslušný počet bodů. Splnění výstupů kontroluje a body přiděluje školitel doktoranda v součinnosti s mentorem, udělené body ověřuje garant předmětu. Pro úspěšné absolvování předmětu musí být bodový zisk alespoň 50 bodů.

Předmět je zaměřen na konkrétní výzkumná témata individualizovaná pro jednotlivé studenty doktorského studijního programu s ohledem na zaměření jejich dizertačních prací. Výuka předmětu probíhá individuální formou, kdy je každému doktorandovi přidělen mentor (interní nebo externí akademický pracovník, případně odborník z praxe). Daný mentor je specializován na problematiku z širšího okruhu teoretických znalostí a odborných dovedností souvisejících s konkrétním výzkumným tématem. V případě tematické příbuznosti dizertací více doktorandů probíhá výuka v šířeji zaměřených týmech. Předmět svou náplní pokrývá témata z oblasti buněčné biologie, elektrofyziologie, zpracování a analýzy signálů a obrazů, strojového učení, bioinformatiky, výpočetní biologie a statistiky.

Konkrétní témata předmětu:
- metody předzpracování, analýzy a zobrazení signálů vysokofrekvenčního EKG,
- optimální metody odhadu kvality signálu EKG,
- metody agregace biosignálů pro multisenzorové systémy sledování aktivity člověka,
- metody detekce mentálních stavů založené na analýze biosignálů mozku a videomonitorování,
- metody analýzy medicínských obrazových dat ze spektrální počítačové tomografie,
- metody analýzy obrazů z multimodálního holografického mikroskopu pro studium buněk,
- metody hlubokého učení pro zpracování obrazových dat v biometrii,
- bioinformatické metody analýzy genové exprese,
- metody rekonstrukce genových regulačních sítí.

Kontrolovatelné výstupy předmětu:
- sestavený podrobný plán studia,
- připravené podklady do výuky (funkční vzorek, software, laboratorní úloha),
- připravený návrh interního grantového projektu univerzitního programu specifického výzkumu,
- připravená a podaná přihláška do soutěže "Brno Ph.D. Talent",
- připravený a odeslaný abstrakt na konferenci mezinárodního významu,
- podrobné hodnocení mentora.

Cílem předmětu je prohloubení a vyvážení teoretických znalostí a odborných dovedností studentů doktorského studijního programu v oblastech souvisejících s jejich dizertačními pracemi.

Studenti předmětu jsou svázáni povinností nashromáždit minimální bodový zisk za kontrolovatelné výstupy. Body uděluje školitel doktoranda v součinnosti s přiděleným mentorem. Udělené body ověřuje garant předmětu.

AKAY, Metin. Wiley encyclopedia of biomedical engineering. Hoboken, N.J.: Wiley-Interscience, c2006. ISBN 978-0-471-24967-2.
ALBERTS, Bruce. Molecular biology of the cell. Sixth edition. New York, NY: Garland Science, Taylor and Francis Group, 2015. ISBN 9780815344322.
COMPEAU, Phillip a Pavel PEVZNER. Bioinformatics algorithms: an active learning approach. La Jolla, CA: Active Learning Publishers, 2014. ISBN 978-0990374602.
JAN, Jiří. Digital signal filtering, analysis and restoration. London: Institution of Electrical Engineers, 2000. IEE telecommunications series, 44. ISBN 0852967608.
JAN, Jiří. Medical image processing, reconstruction, and restoration: concepts and methods. Boca Raton, FL: Taylor & Francis, 2006. ISBN 9780824758493.
LAKOWICZ, Joseph R. Principles of fluorescence spectroscopy. 3rd ed. New York: Springer, c2006. ISBN 978-0-387-31278-1.
ROBINSON, Andrew J a Lynn SNYDER-MACKLER. Clinical electrophysiology: electrotherapy and electrophysiologic testing. 3rd ed. Philadelphia: Wolters Kluwer Health/Lippincott Williams & Wilkins, c2008. ISBN 978-0-7817-4484-3.
StatSoft, Inc. (2013). Electronic Statistics Textbook. Tulsa, OK: StatSoft. WEB: http://www.statsoft.com/textbook/.