Detail předmětu
Pokročilé metody v bioinformatice
FEKT-MPC-PMBAk. rok: 2023/2024
Předmět se zaměřuje na specifické problémy v bioinformatice jako jsou metody de novo skládání genomů, signálové metody zpracování genomů, metagenomiku, zpracování transkriptomu a epigenomu, predikci farmakologických vlastností biomolekul.
Jazyk výuky
čeština
Počet kreditů
3
Garant předmětu
Zajišťuje ústav
Základní literatura
Compeau F., Pevzner P.: Bioinformatics Algorithms. Active Learning Publishers, 2015. (CS)
MacLean, D. R Bioinformatics Cookbook. Use R and Bioconductor to perform RNAseq, genomics, data visualization, and bioinformatic analysis. Packt Publishing, 2019. ISBN 978-1789950694 (EN)
Moorhouse M, Barry P: Bioinformatics Biocomputing and Perl: An Introduction to Bioinformatics Computing Skills and Practice. Wiley; 1 edition, 2004. (EN)
Ohlebusch E.: Bioinformatics Algorithms. Oldenbusch Verlag, 2013. (CS)
MacLean, D. R Bioinformatics Cookbook. Use R and Bioconductor to perform RNAseq, genomics, data visualization, and bioinformatic analysis. Packt Publishing, 2019. ISBN 978-1789950694 (EN)
Moorhouse M, Barry P: Bioinformatics Biocomputing and Perl: An Introduction to Bioinformatics Computing Skills and Practice. Wiley; 1 edition, 2004. (EN)
Ohlebusch E.: Bioinformatics Algorithms. Oldenbusch Verlag, 2013. (CS)
Zařazení předmětu ve studijních plánech
- Program MPC-BTB magisterský navazující 2 ročník, letní semestr, povinně volitelný