Detail předmětu

Úvod do medicínské informatiky

FEKT-BPC-UMIAk. rok: 2024/2025

Předmět je věnován principům využití počítačových technologií v medicíně a biologii. Je orientován na na medicínská data, získávání, archivace a použití, systémy založené na počítačových pacientských záznamech, nemocniční informační systémy, rozhodování v medicíně, pravděpodobnostní usuzování, standardy v medicínské informatice a úvod do bioinformatiky, základy zpracování genetické informace.

Jazyk výuky

čeština

Počet kreditů

5

Garant předmětu

Ing. Helena Vítková, Ph.D.

Zajišťuje ústav

Ústav biomedicínského inženýrství (UBMI)

Vstupní znalosti

Student by měl být schopen vysvětlit základní principy počítačových technologií, měl by znát základní pojmy a způsob použití databázových systémů a měl by ovládat základní znalosti z pravděpodobnostního počtu. Obecně jsou požadovány znalosti na úrovni středoškolského studia.

Pravidla hodnocení a ukončení předmětu

až 40 bodů ze cvičení (2x test a 1x aktivita)
až 60 bodů za písemnou zkoušku
Zkouška je zaměřena na ověření orientace v základních pojmech medicínské informatiky a schopnosti aplikovat základní principy rozhodování v medicíně.
Laboratorní výuka je povinná. Řádně omluvené zameškané hodiny lze nahradit po domluvě s vyučujícím.

Učební cíle

Cílem předmětu je poskytnout základní teoretické znalosti a praktické zkušenosti z oblasti medicínské informatiky. Znalosti pokrývají oblast zpracování specifických medicínských dat, základy návrhu medicínských informačních systémů a počítačově podporovanou medicínskou diagnostiku.
Absolvent předmětu je schopen:
- popsat základní způsoby počítačového zpracování biomedicínských dat,
- vysvětlit základní pojmy medicínské informatiky,
- popsat principy základních metod pravděpodobnostního rozhodování,
- diskutovat výhody a nevýhody jednotlivých metod,
- na základě definovaných požadavků vyhodnotit kvalitu rozhodovacích metod.

Základní literatura

Kalet, I. J. Principles of Biomedical Informatics. Academic Press, 2008. ISBN-10: 0123694388 (EN)
Zvárová, J. a kol.: Biomedicínská informatika I. Karolinum, 1. vyd., 2002. ISBN-10: 80-246-0609-7 (CS)
Zvárová, J. Biomedicínská statistika I. Karolinum, Praha, 2007. ISBN: 978-80-7184-786-1 (CS)

Doporučená literatura

Berka, P. Dobývání znalostí z databází. Praha, Academia 2003. (CS)
J.H. van Bemmel and M.A. Musen: Handbook of Medical Informatics, Springer-Verlag, 1997. ISBN: 3540633510 (EN)
P. Degoulet, B. Phister, M. Fieschi: Introduction to Medical Informatics. Springer-Verlag New York, 1999. ISBN: 0387946411 (EN)

Elearning

eLearning: aktuální otevřený kurz

Zařazení předmětu ve studijních plánech

  • Program BPC-BTB bakalářský 2 ročník, zimní semestr, povinný

Typ (způsob) výuky

 

Přednáška

26 hod., nepovinná

Vyučující / Lektor

Ing. Helena Vítková, Ph.D.

Osnova

1. Počítače v medicíně a biologii. Zpracování informace v biomedicínském výzkumu a klinické praxi.
2. Data a informace v medicíně. Medicínská data, získávání, archivace a použití.
3. Elektronická zdravotní dokumentace. Administrativní činnosti ve zdravotnictví, zejména ve vedení dokumentace týkající se oboru, včetně elektronické podoby této dokumentace.
4. Pravděpodobnost v rozhodování. Rozhodování v medicíně, pravděpodobnostní usuzování.
5. Pravděpodobnost v rozhodování. Schopnost testu diskriminovat mezi chorobou a zdravím, analýza sensitivity, rozhodovací stromy.
6. Pravděpodobnost v interpretaci výsledků testu a v medicínském rozhodování s neurčitostí.
7. Fuzzy množiny.
8. Fuzzy logika a rozhodování v medicíně.
9. Datové standardy v medicínské informatice.
10. Úvod do bioinformatiky.
11. Zpracování genetické informace.

Cvičení na počítači

26 hod., povinná

Vyučující / Lektor

doc. Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D.
Ing. Helena Vítková, Ph.D.
Ing. Roman Jakubíček, Ph.D.
Ing. Markéta Jakubíčková, Ph.D.

Osnova

  1. Úvod, Data a databáze v medicíně
  2. Bioinformatické databáze
  3. Databáze biomedicínských signálů
  4. Databáze biomedicínských obrazů
  5. Uživatelské rozhraní v medicíně
  6. Úvod do databázových systémů
  7. Úvod do jazyka SQL
  8. Elektronická zdravotnická dokumentace
  9. Rozhodování v biomedicíně
  10. Rozhodování v biomedicíně II
  11. Datová vizualizace
  12. (Externí přednáška DICOM a HL7)

Elearning

eLearning: aktuální otevřený kurz