Detail předmětu
Úvod do medicínské informatiky
FEKT-BUMIAk. rok: 2010/2011
Počítače v medicíně a biologii. Data v medicíně. Počítačový pacientský záznam. IZIP - internetový přístup ke zdravotním informacím pacienta. Podpora lékařské diagnostiky. Fuzzy logika a expertní systémy. Biomedicínská statistika. Standardy v medicínské informatice. Úvod do bioinformatiky. Zpracování genetické informace. Úvod do proteomiky. Zpracování a identifikace proteinů. Úloha bioinformatiky v proteomice.
Jazyk výuky
Počet kreditů
Garant předmětu
Zajišťuje ústav
Výsledky učení předmětu
Prerekvizity
Plánované vzdělávací činnosti a výukové metody
Způsob a kritéria hodnocení
Učební cíle
Vymezení kontrolované výuky a způsob jejího provádění a formy nahrazování zameškané výuky
Zařazení předmětu ve studijních plánech
Typ (způsob) výuky
Přednáška
Vyučující / Lektor
Osnova
Data v medicíně. Medicínská data, použití, nevýhody tradičních pacientských záznamů, úloha počítačů v archivaci, získávání a interpretaci dat, databáze a znalostní báze, sběr dat a generování hypotéz, prevalence, prediktivní hodnota, sensitivita a specificita, vstup dat do medicínské databáze.
Počítačový pacientský záznam. Definice počítačového pacientského záznamu (CPR), rozdíl CPR od tradičního záznamu, funkční komponenty CPR, výhody CPR, vývoj a použití CPR.
IZIP - internetový přístup ke zdravotním informacím pacienta.
Podpora lékařské diagnostiky.
Fuzzy logika a expertní systémy.
Biomedicínská statistika.
Standardy v medicínské informatice. Význam standardů v medicínské informatice, standardizační organizace, standardy v managementu medicínských informací, proces vytváření konsenzuálního standardu, faktory tvorby standardů.
Úvod do bioinformatiky.
Zpracování genetické informace.
Uvod do proteomiky - proteiny, jejich stavba, proteom, DNA kodovani proteinu, pojem proteomika, vzajemna interakce proteinu, zdroje, web tutorialy, literatura.
Zpracovani a identifikace proteinu - zpusoby, hmotnostni spektrometrie (tandem MS/MS), zarizeni pro hmotnostni spektrometrii, priprava vzorku a separacni metody (LC, gely), tryptic digest, vznik spektra
Uloha bioinformatiky v proteomice - proteomicke FASTA databaze, interpretace hmotnostniho spektra, search engines (XTandem, Mascot, Sequest, De Novo), prakticka ukazka indentifikace a reprezentace vysledku.
Cvičení na počítači
Vyučující / Lektor
Osnova
Potlačení specifických typů rušení v biologických signálech
Základní druhy zpracování medicínských obrazů
Biostatistické metody v medicíně
Použití diagnostických expertních systémů
Základní modely v biologii a epidemiologii
Úvod do použití medicínského informačního systému MIS CLINICOM
Emulace terminálu a moduly MIS CLINICOM
Vstup textových dat do MIS CLINICOM
Reprezentace dat v MIS CLINICOM
Administrace a přístupová práva v MIS CLINICOM
Výstupní sestavy MIS CLINICOM
Řešení zadaného projektu