Detail produktu

R/Bioconductor package for identification of triplex-forming sequences

HON, J. LEXA, M. MARTÍNEK, T. RAJDL, K.

Typ produktu

software

Abstrakt

This package provides functions for identification and visualization of potential intramolecular triplex patterns in DNA sequence. The main functionality is to detect the positions of subsequences capable of folding into an intramolecular triplex (H-DNA) in a much larger sequence. The potential H-DNA (triplexes) should be made of as many cannonical nucleotide triplets as possible. The package includes visualization showing the exact base-pairing in 1D, 2D or 3D.

Klíčová slova

H-DNA; R/Bioconductor; pattern matching; dynamic programming; triplex; searching; annotation

Datum vzniku

25. 9. 2013

Umístění

http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/triplex.html

Možnosti využití

Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence

Licenční poplatek

Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek

www

http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/triplex.html