Přístupnostní navigace
E-přihláška
Vyhledávání Vyhledat Zavřít
Detail produktu
SEDLÁŘ, K. ŠKUTKOVÁ, H. KOŠČOVÁ, P. VADJÁK, Š. PROVAZNÍK, I.
Typ produktu
software
Abstrakt
Program slouží na především další analýzu dat zpracovaných softwarem Amplicon. Funguje však i s libovolnými sekvencemi uloženými ve FASTA formátu. Analýza spočívá v genotypizaci organismu na základě vstupních sekvencí oproti zvolené referenční databázi. K tomu využívá algoritmus BLAST. Výstupem je tabulka nejpodobnějších sekvencí ke každé sekvenci dotazu, je možný i výstup ve formátu proměnné MATLAB či, excel tabulky.
Klíčová slova
genotypizace, amplikon
Datum vzniku
16. 9. 2014
Umístění
Ústav biomedicínského inženýrství, FEKT VUT v Brně, Technická 12 61600 Brno
Možnosti využití
Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)
Licenční poplatek
Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek
www
http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty