Detail produktu

pqsfinder: an R/Bioconductor package for identification of potential quadruplex forming sequences

HON, J. LEXA, M. MARTÍNEK, T. ZENDULKA, J.

Typ produktu

software

Abstrakt

The main functionality of the this package is to detect DNA sequence patterns that are likely to fold into an intramolecular G-quadruplex (G4). Unlike many other approaches, this package is able to detect sequences responsible for G4s folded from imperfect G-runs containing bulges or mismatches and as such is more sensitive than competing algorithms.

Klíčová slova

G-quadruplex; quadruplex; DNA; R; Bioconductor; pattern matching; searching; annotation

Datum vzniku

24. 10. 2016

Umístění

http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/pqsfinder.html

Možnosti využití

Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence

Licenční poplatek

Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek

www

http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/pqsfinder.html