Detail publikace

Fylogenetická stromová struktura vybraných sub-rodin metallothioneinů

ŠKUTKOVÁ, H. PROVAZNÍK, I. KIZEK, R.

Originální název

Fylogenetická stromová struktura vybraných sub-rodin metallothioneinů

Anglický název

Phylogenetic tree structure of metallothionen sub-family

Typ

článek ve sborníku ve WoS nebo Scopus

Jazyk

čeština

Originální abstrakt

Metallothioneiny (MT) jsou malé na cysteiny bohaté proteiny, které v organismu zajišťují transport kovů. Přestože byli MT poprvé popsány již roku 1957 všechny jejich možnosti a vlivy na organismus nejsou zatím dostatečně objasněny. Pro zjištění podobnosti molekulární struktury bílkovin jsme využili fylogenetickou analýzu, která zjišťuje evoluční příbuznost organismů. Protože celá veřejná databáze obsahuje přes 1000 záznamů z obrovské rodiny MT zařazených jak do eukaryotických tak prokaryotických organismů, zkonstruovali jsme několik fylogenetických stromů pro určité vybrané taxonomické skupiny MT: bakterie, lidé a rostliny.

Anglický abstrakt

Metallothioneins (MTs) are small cysteine-rich proteins that are involved in many diverse biological processes. These multifunction proteins constitute a superfamily. They are found not only in eukaryotes, but also in prokaryotic micro organisms. Although they keep analogical function, their primary structures are often diverse. Phylogenetic analysis reveals similarities and dissimilarities in sequence structures among various subfamilies of MTs.

Klíčová slova

fylogenetický strom, neigbour-joining, BIONJ, Jukes-Cantor, metallothionein

Klíčová slova v angličtině

Metallothionein, phylogenetic, sequence motif, sequence logo, BIONJ

Autoři

ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R.

Rok RIV

2010

Vydáno

20. 4. 2010

Nakladatel

Muni Press

Místo

Brno

ISBN

978-80-210-5164-5

Kniha

XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů

Číslo edice

14

Strany od

77

Strany do

78

Strany počet

2

BibTex

@inproceedings{BUT29966,
  author="Helena {Vítková} and Valentine {Provazník} and René {Kizek}",
  title="Fylogenetická stromová struktura vybraných sub-rodin metallothioneinů",
  booktitle="XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů",
  year="2010",
  number="14",
  pages="77--78",
  publisher="Muni Press",
  address="Brno",
  isbn="978-80-210-5164-5"
}