Přístupnostní navigace
E-přihláška
Vyhledávání Vyhledat Zavřít
Detail publikace
ŠILHAVÁ, J. SMRŽ, P.
Originální název
Gene Ontology Driven Feature Filtering from Microarray Data
Anglický název
Typ
článek ve sborníku mimo WoS a Scopus
Jazyk
čeština
Originální abstrakt
Microarray data is high-dimensional and noisy. Dimension reduction, i.e. selecting a small number of genes, is an effective way to improve mining efficiency. We propose a novel approach that integrates gene ontology knowledge at the level of feature selection into microarray data to improve binary class prediction. The advantage of this filtering approach lies in considering gene-to-gene relations and selecting more meaningful features comparing to the methods evaluating genes in isolation. In addition, gene ontology knowledge can overcome the limitations of noisy microarray data. Our approach is evaluated on a real benchmark dataset.
Anglický abstrakt
Klíčová slova v angličtině
feature selection, gene ontology, microarray data, class prediction
Autoři
ŠILHAVÁ, J.; SMRŽ, P.
Rok RIV
2010
Vydáno
1. 1. 2010
Místo
Jindřichův Hradec
ISBN
978-80-245-1636-3
Kniha
Znalosti 2010
Edice
9th Annual Conference, Jindřichův Hradec
Strany od
263
Strany do
266
Strany počet
4
BibTex
@inproceedings{BUT30857, author="Jana {Šilhavá} and Pavel {Smrž}", title="Gene Ontology Driven Feature Filtering from Microarray Data", booktitle="Znalosti 2010", year="2010", series="9th Annual Conference, Jindřichův Hradec", pages="263--266", address="Jindřichův Hradec", isbn="978-80-245-1636-3" }