Přístupnostní navigace
E-přihláška
Vyhledávání Vyhledat Zavřít
Detail publikace
BARTOŇ, V. NYKRÝNOVÁ, M. BEZDÍČEK, M. LENGEROVÁ, M. ŠKUTKOVÁ, H.
Originální název
Clustering of Klebsiella Strains Based on Variability in Sequencing Data
Typ
článek ve sborníku ve WoS nebo Scopus
Jazyk
angličtina
Originální abstrakt
Genotyping is a method necessary to distinguish between strains of bacteria. Using whole sequences for analysis is a computational demanding and time-consuming approach. We establish a workflow to convert sequences to a numerical signal representing the variability of sequences. After segmentation and using only parts of the signals, they have still enough information to form a topologically according to the clustering structure.
Klíčová slova
Genotyping; Klebsiella pneumoniae; Variability signal; Numerical processing;
Autoři
BARTOŇ, V.; NYKRÝNOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H.
Vydáno
13. 4. 2019
ISBN
978-3-030-17934-2
Kniha
Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2019.
Číslo edice
11466
ISSN
0302-9743
Periodikum
Lecture Notes in Computer Science
Stát
Spolková republika Německo
Strany od
189
Strany do
199
Strany počet
11
BibTex
@inproceedings{BUT156910, author="Vojtěch {Bartoň} and Markéta {Jakubíčková} and Matěj {Bezdíček} and Martina {Lengerová} and Helena {Vítková}", title="Clustering of Klebsiella Strains Based on Variability in Sequencing Data", booktitle="Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2019.", year="2019", journal="Lecture Notes in Computer Science", number="11466", pages="189--199", doi="10.1007/978-3-030-17935-9\{_}18", isbn="978-3-030-17934-2", issn="0302-9743" }