Publication detail

Metody sekvenování druhé a třetí generace a jejich praktické využití pro typizaci bakterií

BEZDÍČEK, M. DUFKOVÁ, K. NYKRÝNOVÁ, M. HANSLIKOVA, J. LENGEROVÁ, M.

Original Title

Metody sekvenování druhé a třetí generace a jejich praktické využití pro typizaci bakterií

English Title

Application of second- and third-generation sequencing for bacterial typing

Type

journal article in Scopus

Language

Czech

Original Abstract

Metody sekvenování nové generace nám umožňují zcela zásadním způsobem prohloubit znalosti o studovaných mikroorganismech a data získaná celogenomovým sekvenováním lze využít pro řadu různých analýz. Autoři článku poskytují přehled a příklady použití celogenomové sekvenace pro molekulární typizaci bakterií. Článek je zaměřen na popis principu jednotlivých sekvenačních metod, vyhodnocení získaných výsledků a jejich použití v praxi.

English abstract

New-generation sequencing methods allow us to fundamentally deepen our knowledge of the studied microorganisms, and the data obtained by whole-genome sequencing can be used for a number of different analyses. The authors of the article provide an overview and examples of the use of whole-genome sequencing for molecular typing of bacteria. The article is focused on the description of the principle of individual sequencing methods, the evaluation of the obtained results and their use in practice.

Keywords

celogenomové sekvenování; molekulární typizace; nemocniční epidemiologie

Key words in English

whole-genome sequencing, molecular typing, hospital epidemiology

Authors

BEZDÍČEK, M.; DUFKOVÁ, K.; NYKRÝNOVÁ, M.; HANSLIKOVA, J.; LENGEROVÁ, M.

Released

1. 12. 2022

Publisher

TRIOS, spol. s r.o.

Location

Praha

ISBN

1211-264X

Periodical

Klinicka Mikrobiologie a Infekcni Lekarstvi

Year of study

28

Number

4

State

Czech Republic

Pages from

106

Pages to

115

Pages count

10

URL

https://trios.cz/wp-content/uploads/2023/09/KMIL_04-22.pdf

BibTex

@article{BUT184408,
  author="Matěj {Bezdíček} and Kristýna {Dufková} and Markéta {Jakubíčková} and Jana {Hanslikova} and Martina {Lengerová}",
  title="Metody sekvenování druhé a třetí generace a jejich praktické využití pro typizaci bakterií",
  journal="Klinicka Mikrobiologie a Infekcni Lekarstvi",
  year="2022",
  volume="28",
  number="4",
  pages="106--115",
  issn="1211-264X",
  url="https://trios.cz/wp-content/uploads/2023/09/KMIL_04-22.pdf"
}