Detail publikace

Metody sekvenování druhé a třetí generace a jejich praktické využití pro typizaci bakterií

BEZDÍČEK, M. DUFKOVÁ, K. NYKRÝNOVÁ, M. HANSLIKOVA, J. LENGEROVÁ, M.

Originální název

Metody sekvenování druhé a třetí generace a jejich praktické využití pro typizaci bakterií

Anglický název

Application of second- and third-generation sequencing for bacterial typing

Typ

článek v časopise ve Scopus, Jsc

Jazyk

čeština

Originální abstrakt

Metody sekvenování nové generace nám umožňují zcela zásadním způsobem prohloubit znalosti o studovaných mikroorganismech a data získaná celogenomovým sekvenováním lze využít pro řadu různých analýz. Autoři článku poskytují přehled a příklady použití celogenomové sekvenace pro molekulární typizaci bakterií. Článek je zaměřen na popis principu jednotlivých sekvenačních metod, vyhodnocení získaných výsledků a jejich použití v praxi.

Anglický abstrakt

New-generation sequencing methods allow us to fundamentally deepen our knowledge of the studied microorganisms, and the data obtained by whole-genome sequencing can be used for a number of different analyses. The authors of the article provide an overview and examples of the use of whole-genome sequencing for molecular typing of bacteria. The article is focused on the description of the principle of individual sequencing methods, the evaluation of the obtained results and their use in practice.

Klíčová slova

celogenomové sekvenování; molekulární typizace; nemocniční epidemiologie

Klíčová slova v angličtině

whole-genome sequencing, molecular typing, hospital epidemiology

Autoři

BEZDÍČEK, M.; DUFKOVÁ, K.; NYKRÝNOVÁ, M.; HANSLIKOVA, J.; LENGEROVÁ, M.

Vydáno

1. 12. 2022

Nakladatel

TRIOS, spol. s r.o.

Místo

Praha

ISSN

1211-264X

Periodikum

Klinicka Mikrobiologie a Infekcni Lekarstvi

Ročník

28

Číslo

4

Stát

Česká republika

Strany od

106

Strany do

115

Strany počet

10

URL

https://trios.cz/wp-content/uploads/2023/09/KMIL_04-22.pdf

BibTex

@article{BUT184408,
  author="Matěj {Bezdíček} and Kristýna {Dufková} and Markéta {Jakubíčková} and Jana {Hanslikova} and Martina {Lengerová}",
  title="Metody sekvenování druhé a třetí generace a jejich praktické využití pro typizaci bakterií",
  journal="Klinicka Mikrobiologie a Infekcni Lekarstvi",
  year="2022",
  volume="28",
  number="4",
  pages="106--115",
  issn="1211-264X",
  url="https://trios.cz/wp-content/uploads/2023/09/KMIL_04-22.pdf"
}