Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

FITZkratka: MBIAk. rok: 2022/2023

Program: Informační technologie

Délka studia: 2 roky

Akreditace od: 1.1.2005Akreditace do: 31.12.2024

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení

Student oboru získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti v oboru bioinformatiky a počítání podle přírody a získá tak potřebné znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování problémů biologických databází, algoritmů pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky, využití technik počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení.

Profesní profil absolventů s příklady


  • Absolventi mají pokročilé znalosti bioinformatiky, počítání podle přírody (natural computing) a orientují se v principech molekulární genetiky. Dovedou využívat biologické databáze, používat, vytvářet a akcelerovat algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Dokáží aplikovat techniky počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení a tím dosáhnout vylepšení jejich parametrů. 
  • Absolventi mají hluboké teoretické a praktické znalosti v oboru informačních technologií, a to zejména v oblastech pokročilých databázových systémů, teoretické informatiky, hardware/software codesignu a paralelních a distribuovaných algoritmů.
  • Absolventi jsou připraveni pro projektování, provoz a správu bioinformatických počítačových systémů. Jsou schopni aplikovat biologií inspirované metody při návrhu i realizaci výpočetních systémů. Jsou schopni navrhnout a provést experiment, analyzovat a interpretovat data, pracovat samostatně i v týmu, prezentovat výsledky a dále se vzdělávat jak v informatice tak i biologii. 
  • Možné uplatnění je v profesích jako projektant nebo správce bioinformatických počítačových systémů používaných v biotechnologických firmách, zdravotnictví, kriminalistice apod. Absolvent oboru dále uplatní získané vzdělání ve vývojových a výzkumných odděleních firem a institucí zabývajících se vývojem bionformatických systémů nebo výpočetních systémů, které využívají prvky moderní umělé inteligence.

Garant


Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)

1. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIOBiometrické systémycs, en5Povinnýano
MATMatematické struktury v informaticecs, en5Povinnýne
BC_MOG1Molekulární genetika Ics3Povinnýano
PDBPokročilé databázové systémycs, en5Povinnýano
TINTeoretická informatikacs7Povinnýano
1. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIFBioinformatikacs5Povinnýano
BINBiologií inspirované počítačecs5Povinnýano
PRLParalelní a distribuované algoritmycs5Povinnýano
PP1Projektová praxe 1cs, en5Volitelnýano
2. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
PBIPokročilá bioinformatikacs4Povinnýano
SEPSemestrální projektcs, en5Povinnýano
SFCSoft Computingcs5Povinnýano
THETeorie hercs5Povinnýano
ZZNZískávání znalostí z databázícs5Povinnýano
PP2Projektová praxe 2cs5Volitelnýano
2. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
DIPDiplomová prácecs, en13Povinnýano
Libovolný ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
HSCHardware/Software Codesigncs, en5Povinně volitelnýHardware a sítěano
PCSPokročilé číslicové systémycs5Povinně volitelnýHardware a sítěano
JA3Anglická konverzace na aktuální tématacs, en3Povinně volitelnýHumanitní předmětano
FCEAngličtina: praktický kurz obchodní konverzace a prezentacecs, en3Povinně volitelnýHumanitní předmětano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelnýHumanitní předmětano
FITDějiny a filozofie technikycs2Povinně volitelnýHumanitní předmětano
FIKFilozofie a kulturacs2Povinně volitelnýHumanitní předmětano
HKOManažerská komunikace a prezentacecs, en3Povinně volitelnýHumanitní předmětano
HVRManažerské vedení lidí a řízení časucs, en3Povinně volitelnýHumanitní předmětano
PRMPrávní minimumcs2Povinně volitelnýHumanitní předmětano
RETRétorikacs2Povinně volitelnýHumanitní předmětano
AGSAgentní a multiagentní systémycs5Povinně volitelnýModerní umělá inteligenceano
SINInteligentní systémycs5Povinně volitelnýModerní umělá inteligenceano
BISBezpečnost informačních systémůcs5Povinně volitelnýOperační systémy a bezpečnostano
ZPJaZpracování přirozeného jazyka (v angličtině)en5Povinně volitelnýZpracování dat a signálůano
AISAnalýza a návrh informačních systémůcs5Volitelnýano
AVSArchitektury výpočetních systémůcs5Volitelnýano
BMSBezdrátové a mobilní sítěcs5Volitelnýano
EIPEkonomie informačních produktůcs5Volitelnýne
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normycs5Volitelnýano
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javěcs, en5Volitelnýano
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Windowcs5Volitelnýne
GMUGrafické a multimediální procesorycs5Volitelnýne
GALGrafové algoritmycs, en5Volitelnýano
PGRPočítačová grafikacs, en5Volitelnýano
POVaPočítačové vidění (v angličtině)en5Volitelnýano
PGPaPokročilá počítačová grafika (v angličtině)en5Volitelnýano
PKSaPokročilé komunikační systémy (v angličtině)en5Volitelnýano
PDIProstředí distribuovaných aplikacícs, en5Volitelnýano
ROBaRobotika (v angličtině)en5Volitelnýano
SEMSenzory a měřenícs5Volitelnýano
SAVStatická analýza a verifikacecs5Volitelnýano
SRIStrategické řízení informačních systémůcs5Volitelnýano
TAMaTvorba aplikací pro mobilní zařízení (v angličtině)en5Volitelnýano
VYPaVýstavba překladačů (v angličtině)en5Volitelnýano
VINVýtvarná informatikacs5Volitelnýano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelnýano
Libovolný ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
NAVNávrh vestavěných systémůcs5Povinně volitelnýHardware a sítěano
PPPPraktické paralelní programovánícs5Povinně volitelnýHardware a sítěano
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokolycs, en5Povinně volitelnýHardware a sítěano
JA3Anglická konverzace na aktuální tématacs, en3Povinně volitelnýHumanitní předmětano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelnýHumanitní předmětano
FITDějiny a filozofie technikycs2Povinně volitelnýHumanitní předmětano
FIKFilozofie a kulturacs2Povinně volitelnýHumanitní předmětano
HKOManažerská komunikace a prezentacecs, en3Povinně volitelnýHumanitní předmětano
HVRManažerské vedení lidí a řízení časucs, en3Povinně volitelnýHumanitní předmětano
PRMPrávní minimumcs2Povinně volitelnýHumanitní předmětano
RETRétorikacs2Povinně volitelnýHumanitní předmětano
EVOAplikované evoluční algoritmycs5Povinně volitelnýModerní umělá inteligenceano
SNTSimulační nástroje a technikycs5Povinně volitelnýModerní umělá inteligenceano
KRYKryptografiecs5Povinně volitelnýOperační systémy a bezpečnostano
NSBNávrh, správa a bezpečnostcs5Povinně volitelnýOperační systémy a bezpečnostano
POSPokročilé operační systémycs5Povinně volitelnýOperační systémy a bezpečnostano
KKOKódování a komprese datcs5Povinně volitelnýZpracování dat a signálůano
ZREZpracování řečových signálůcs, en5Povinně volitelnýZpracování dat a signálůano
MBAAnalýza systémů založená na modelechcs5Volitelnýano
BZABezpečná zařízenícs5Volitelnýano
CSOaCCNA Kybernetická bezpečnost (v angličtině)en5Volitelnýano
DFAaDigitální forenzní analýza (v angličtině)en5Volitelnýano
DJADynamické jazykycs5Volitelnýne
FLPFunkcionální a logické programovánícs5Volitelnýano
FVSFunkční verifikace číslicových systémůcs5Volitelnýne
FYOFyzikální optikacs, en5Volitelnýano
GISGeografické informační systémycs5Volitelnýne
WAPInternetové aplikacecs5Volitelnýano
LOGLogikacs5Volitelnýano
MPRManagement projektůcs5Volitelnýano
MPC-MATMaticový a tenzorový početcs5Volitelnýano
MULMultimédiacs, en5Volitelnýano
OPMOptimalizacecs4Volitelnýano
PISPokročilé informační systémycs5Volitelnýano
PMAProjektový manažercs5Volitelnýano
SLOaSložitost (v angličtině)en5Volitelnýano
MPA-SYSSystems Biologyen5Volitelnýano
SPPSystémy odolné proti poruchámcs5Volitelnýano
RTSaSystémy pracující v reálném čase (v angličtině)en5Volitelnýano
UXIaUživatelská zkušenost a návrh rozhraní a služeb (v angličtině)en5Volitelnýano
VIZaVizualizace a CAD (v angličtině)en5Volitelnýano
VYFVýpočetní fotografiecs5Volitelnýano
VGEVýpočetní geometriecs, en5Volitelnýano
VNVVysoce náročné výpočtycs, en5Volitelnýano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelnýano
ZPOZpracování obrazucs, en5Volitelnýano
Všechny skupiny volitelných předmětů
Sk. Počet kreditů Počet předm. Předměty
Hardware a sítě nekontroluje se 1 - 9 HSC, PCS, NAV, PPP, PDS
Humanitní předmět 3 kr 1 JA3 (3 kr) zimní/letní sem., FCE (3 kr), AEU (3 kr) zimní/letní sem., FIT (2 kr) zimní/letní sem., FIK (2 kr) zimní/letní sem., HKO (3 kr) zimní/letní sem., HVR (3 kr) zimní/letní sem., PRM (2 kr) zimní/letní sem., RET (2 kr) zimní/letní sem.
Moderní umělá inteligence nekontroluje se 1 - 9 AGS, SIN, EVO, SNT
Operační systémy a bezpečnost nekontroluje se 1 - 9 BIS, KRY, NSB, POS
Zpracování dat a signálů nekontroluje se 1 - 9 ZPJa, KKO, ZRE