Detail projektu

Methylation detection in Aneurinibacillus bacteria genome using nanopore sequencing

Období řešení: 01.03.2024 — 28.02.2025

Zdroje financování

Vysoké učení technické v Brně - Vnitřní projekty VUT

- plně financující (2024-01-01 - 2025-12-31)

O projektu

The submitted project aims to develop a robust methylation detection pipeline utilizing ONT sequencing for in-depth analysis of Aneurinibacillus sp. methylomes. It is centered on a comparative analysis of two sequencing techniques (ONT and PacBio) for methylation detection. This serves as foundational knowledge to create a new neural network aimed at enhancing the accuracy of ONT. This endeavor will provide us with novel insights into the role of methylomes in bacteria cultivated under stress conditions.

Označení

FCH/FEKT-J-24-8516

Originální jazyk

čeština

Řešitelé

Umair Mohammad - hlavní řešitel
Obruča Stanislav, prof. Ing., Ph.D. - spoluřešitel
Řeháková Veronika, Ing. - spoluřešitel
Sedlář Karel, doc. Mgr. Ing., Ph.D. - spoluřešitel

Útvary

Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
- příjemce (01.01.2024 - 31.12.2024)
Fakulta chemická
- interní (01.01.2024 - 31.12.2024)
Ústav biomedicínského inženýrství
- interní (01.01.2024 - 31.12.2024)
Ústav chemie potravin a biotechnologií
- interní (01.01.2024 - 31.12.2024)

Výsledky

UMAIR, M.; ŘEHÁKOVÁ, V.; BEZDÍČEK, M.; BUCHTÍKOVÁ, I.; OBRUČA, S.; SEDLÁŘ, K. Study of Methylomes in Aneurinibacillus Species using Third Generation Sequencing Platform. 9th Meeting on Chemistry & Life, Book of Abstracts. 1. 2024. p. 55-55.
Detail

UMAIR, M.; ŘEHÁKOVÁ, V.; BUCHTÍKOVÁ, I.; BEZDÍČEK, M.; OBRUČA, S.; SEDLÁŘ, K. Bioinformatics study of the third generation sequencing platforms applied on a thermophile. Proceedings I of the 30 th Conference STUDENT EEICT 2024. 1. 2024. ISBN: 978-80-214-6231-1.
Detail

Odpovědnost: Umair Mohammad