Detail publikace

Compressed DNA signal representation for classification of long sequences

SEDLÁŘ, K. ŠKUTKOVÁ, H. PROVAZNÍK, I.

Originální název

Compressed DNA signal representation for classification of long sequences

Typ

článek ve sborníku ve WoS nebo Scopus

Jazyk

angličtina

Originální abstrakt

The whole genome sequencing became standard part of nucleic acids' research due to the development of next-generation sequencing platforms. However, an algorithmic processing of long sequences is computationally demanding. We present a new method for lossy compression of DNA in a form of cumulative phase signals. This compression is convenient for comparison of various sequences in short time.

Klíčová slova

cumulated phase, DNA, compression, long sequence

Autoři

SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.

Rok RIV

2013

Vydáno

29. 5. 2013

Nakladatel

LITERA BRNO

Místo

Brno

ISBN

978-80-7375-757-1

Kniha

XIII pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků

Edice

1.

Číslo edice

1.

Strany od

135

Strany do

136

Strany počet

2

BibTex

@inproceedings{BUT101200,
  author="Karel {Sedlář} and Helena {Vítková} and Valentine {Provazník}",
  title="Compressed DNA signal representation for classification of long sequences",
  booktitle="XIII pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků",
  year="2013",
  series="1.",
  number="1.",
  pages="135--136",
  publisher="LITERA BRNO",
  address="Brno",
  isbn="978-80-7375-757-1"
}