Detail publikace

Parametry vstupních dat pro analýzu metodou DCM

SLAVÍČEK, T. MIKL, M. JAN, J.

Originální název

Parametry vstupních dat pro analýzu metodou DCM

Anglický název

Input data parameters for analysis using DCM method

Typ

abstrakt

Jazyk

čeština

Originální abstrakt

Metoda dynamického kauzálního modelování (DCM) je v poslední době často využívána v neurovědní komunitě pro zjišťování tzv. efektivní konektivity mozku. Vypočtené parametry navržených modelů však úzce souvisí s výběrem výchozích souřadnic pro extrakci signálů. Tato práce se zabývá různými způsoby výběru souřadnic a zmiňuje některá úskalí při provádění DCM analýzy v toolboxu SPM8. Během předzpracování je také vhodné identifikovat případné nekonzistentní výsledky v souboru naměřených dat a zvážit jejich vyřazení před vlastní DCM analýzou. V práci je dále představen softwarový nástroj, který slouží k řešení zmíněných problémů. Jeho přínos je ověřen na reálných datech funkční magnetické rezonance a výsledky zhodnoceny v závěru práce.

Anglický abstrakt

Method of dynamic causal modeling (DCM) is frequently used in the neuroscience community to identify the effective connectivity of the brain. Calculated parameters of the proposed models are closely related to the selection of initial coordinates for extraction of signals. This work deals with different ways of choosing coordinates and mentions some of the pitfalls in DCM implementation in the SPM8 toolbox. During the pre-processing it is also useful to identify any inconsistent results in the set of measured data and consider their removal prior to DCM analysis. This work also introduced a software tool that is used to solve mentioned problems, its contribution is validated on real data from functional magnetic resonance imaging, and the results are evaluated in the conclusion.

Klíčová slova

mozek, fMRI, funkční magnetická rezonance, DCM, dynamické kauzální modelování, konektivita, BOLD signál, SPM8, regresor, BMS, Bayesian model selection, MATLAB

Klíčová slova v angličtině

brain, fMRI, functional magnetic resonance imaging, DCM, dynamic causal modelling, connectivity, BOLD signal, SPM8, regressor, BMS, Bayesian model selection, MATLAB

Autoři

SLAVÍČEK, T.; MIKL, M.; JAN, J.

Vydáno

7. 11. 2012

Nakladatel

Ambit Media, a.s.

Místo

Media Hall, Bidláky 20, 639 00 Brno

ISSN

1210-7859

Periodikum

Česká a slovenská neurologie a neurochirurgie

Ročník

75

Číslo

108

Stát

Česká republika

Strany od

54

Strany do

54

Strany počet

1

URL

http://www.csneurol.sk/userfiles/files/CSNN_Suppl2012.pdf

BibTex

@misc{BUT95048,
  author="Tomáš {Slavíček} and Michal {Mikl} and Jiří {Jan}",
  title="Parametry vstupních dat pro analýzu metodou DCM",
  year="2012",
  journal="Česká a slovenská neurologie a neurochirurgie",
  volume="75",
  number="108",
  pages="54--54",
  publisher="Ambit Media, a.s.",
  address="Media Hall,
Bidláky 20,
639 00 Brno",
  issn="1210-7859",
  url="http://www.csneurol.sk/userfiles/files/CSNN_Suppl2012.pdf",
  note="abstract"
}