čeština

Student by měl být schopen vysvětlit základní principy klasické genetiky, měl by znát základní pojmy a zákony molekulární biologie a měl by ovládat základní znalosti z číslicového zpracování signálů. Obecně jsou požadovány znalosti na úrovni středoškolského studia. Dále by měl student ovládat programování v jazyce Python.

až 40 bodů ze cvičení (2 průběžné testy (5 x 2 body), jeden programovací test (10 bodů), jedna zápočtová písemka (20 bodů))
až 60 bodů za písemnou zkoušku

Zkouška je zaměřena na ověření orientace v základních pojmech bioinformatiky, schopnosti navrhnout způsob analýzy sekvencí, prakticky provést operace se sekvencemi.
Počítačová cvičení jsou povinná. Omluvit lze nejvýše jednu neúčast na cvičeních; podmínkou omluvy je pouze potvrzená pracovní neschopnost nebo podobně vážný důvod; uznání účasti ve cvičení je podmíněno tím, že student do něj přichází připraven se znalostí dosud odpřednášené látky.

Cílem předmětu je poskytnout studentům základní orientaci v problematice bioinformatiky, konkrétně v náhledu na strukturu informací v biologických databázích a způsob jejich využití a metodách analýzy sekvencí získaných z biologických databází.
Absolvent předmětu je schopen:
- získávat informace z biologických databází,
- vysvětlit základní pojmy bioinformatiky,
- popsat principy základních metod analýzy sekvencí z biologických databází,
- diskutovat výhody a nevýhody jednotlivých metod,
- na základě definovaných požadavků navrhnout vlastní metody analýzy sekvencí.

LESK, Arthur, 2019. Introduction to bioinformatics. Oxford University Press. ISBN 978-019-8794-141 (EN)
PEVSNER, Jonathan, 2015. Bioinformatics and functional genomics. Third edition. Chichester: Wiley-Blackwell. ISBN 978-1-118-58178-0 (EN)