Detail projektu

Analýza 3D objektů s narušenou periodicitou

Období řešení: 01.09.1999 — 28.02.2001

Zdroje financování

Grantová agentura České republiky - Standardní projekty

- plně financující (1999-01-01 - 2001-02-28)

O projektu

V rámci nosného grantu je vytvoření experimentální sestavy optických pastí k definovanému prostorovému přemísťování a otáčení mikroobjektů při jejich pozorování v mikroskopu a její aplikace umožňující snadnější analýzu struktur biologických mikroobjektů.Podstatou navrhovaného postdoktorandského projektu je rozšíření aplikační části nosného projektu o analýzu objektů s narušenou periodicitou. Jde zejména o narušení periodicity vzniklé přípravou preparátu, velkým šumem apod.Projekt se skládá ze dvou částí: obrazové analýzy projekcí objektů (2D analýza - určení periodicity, typu symetrie, 2D rekonstrukce) a následné 3D rekonstrukce objektů z jejich projekcí. Pro tyto účely je potřeba získat projekce objektů z přesně definovaných směrů, k čemu bude užita sestava z nosného grantu.Bude kladen důraz na analýzu silně deformovaných kvaziperiodických struktur, zejména se spojitou deformací.Cílem projektu tedy je: studium deformací mřížek (teoretické modely, jejich Fourierova a vlnková transformace

Popis anglicky
In frames of the main project an experimental setup of optical tweezers for space shift and rotation of microobjects that can be used for manipulation of the objects in microscope will be developed. The application enables simpler analysis of biologicalstructures of the microobjects. The objective of this postdoctorand project is broadening of the application part on analysis of imperfectly ordered objects. The imperfection is mostly given by preparation of the objects, high noise etc. The project consists of the two parts: image analysis of projections of the objects (2D analysis - finding lattice parameters, type of symmetry, 2D reconstruction) and 3D reconstruction of the objects from their projections. For this it is necessary to obtain projections of the objects in strictly defined directions. The experimental setup from the main project will be used for this purpose. The main goal will be the analysis of strongly distorted lattices, especially continuously distorted lattices. The aim

Označení

GA101/99/D077

Originální jazyk

čeština

Řešitelé

Útvary

Fakulta strojního inženýrství
- příjemce (01.01.1999 - 28.02.2001)

Výsledky

DOBRANSKÁ, K.; NEBESÁŘOVÁ, J.; RŮŽIČKA, F.; DLUHOŠ, J.; KRZYŽÁNEK, V. Characterization of yeast biofilm by cryo-SEM and FIB-SEM. MICROSCOPY AND MICROANALYSIS, 2013, vol. 19, no. S2, p. 226-227. ISSN: 1431-9276.
Detail

KRZYŽÁNEK, V.; TACKE, S.; DOBRANSKÁ, K.; REICHELT, R. Beyond Imaging: Scanning Electron Microscope for the Quantitative Mass Measurement. MICROSCOPY AND MICROANALYSIS, 2013, vol. 19, no. S2, p. 130-131. ISSN: 1431-9276.
Detail

DOBRANSKÁ, K.; KRZYŽÁNEK, V.; SAMEK O.; RŮŽIČKA F.; NEBESÁŘOVÁ J.; WEPF RA. Characterisation of bacterial/yeast biofilms by scanning electron microscopy. In Proceedings of the 15th European Microscopy Congress. 2012. p. 671-672. ISBN: 978-0-9502463-5-2.
Detail

K. Hrubanova; S. Bernatova; O. Samek; M. Sery; P. Zemanek; J. Nebesarova; F. Ruzicka; V. Krzyzanek. Monitoring of Multilayered Bacterial Biofilm Morphology by Cryo-SEM for Raman Spectroscopy Measurements. MICROSCOPY AND MICROANALYSIS, 2015, vol. 21, no. S3, p. 187-188. ISSN: 1431-9276.
Detail

HRUBANOVÁ, K.; VOBERKOVÁ, S.; HERMANOVÁ, S.; KRZYŽÁNEK, V. Characterization of Polycaprolactone Films Biodeterioration by Scanning Electron Microscopy. MICROSCOPY AND MICROANALYSIS, 2014, vol. 20, no. S3, p. 1950-1951. ISSN: 1431-9276.
Detail

NOVOTNÁ, V.; HRUBANOVÁ, K.; NEBESÁŘOVÁ, J.; KRZYŽÁNEK, V. Investigation of Electron Beam Induced Mass Loss of Embedding Media in the Low Voltage STEM. MICROSCOPY AND MICROANALYSIS, 2014, vol. 20, no. S3, p. 1270-1271. ISSN: 1431-9276.
Detail

BURDIKOVÁ Z.; HICKEY C.; AUTY M.A.E.; PALA J.; ŠVINDRYCH Z.; STEINMETZ I.; KRZYŽÁNEK V.; HRUBANOVÁ K.; SHEEHAN J.J. Cheese Matrix Microstructure Studied by Advanced Microscopic Techniques. MICROSCOPY AND MICROANALYSIS, 2014, vol. 20, no. S3, p. 1336-1337. ISSN: 1431-9276.
Detail

KRZYŽÁNEK, V.; HRUBANOVÁ, K.; NEBESÁŘOVÁ, J; RUŽIČKA, F. Cryo-SEM of Perpendicular Cross Freeze-Fractures Through a High-Pressure-frozen Biofilm. MICROSCOPY AND MICROANALYSIS, 2014, vol. 20, no. S3, p. 1232-1233. ISSN: 1431-9276.
Detail