Publikace

• 2024

  VAIBAROVA, V.; KRÁLOVÁ, S.; PALÍKOVÁ, M.; SCHWARZEROVÁ, J.; NEJEZCHLEBOVÁ, J.; ČEJKOVÁ, D.; ČÍŽEK, A. Genetic and phenotypic diversity of Flavobacterium psychrophilum isolates from Czech salmonid fish farms. BMC MICROBIOLOGY, 2024, roč. 24, č. 1, s. 1-15. ISSN: 1471-2180.
  Detail | WWW

  SCHWARZEROVÁ, J.; RAJASEKARAN, L.; JUREČKOVÁ, K.; NEJEZCHLEBOVÁ, J.; VARGA, M.; PROVAZNÍK, V.; WECKWERTH, W.; ČEJKOVÁ, D. Visualizing Horizontal Gene Transfer Detection in Phylogenetically Divergent Bacteria. In Lecture Notes in Bioinformatics. Lecture Notes in Computer Science. 14849. Springer Nature, 2024. s. 267-277. ISBN: 978-3-031-64636-2. ISSN: 1611-3349.
  Detail | WWW

• 2023

  KNAUF, S.; HISGEN, L.; AGREN, E.; BARLOW, A.; FAEHNDRICH, M.; VOIGT, U.; FISCHER, L.; GRILLOVÁ, L.; HALLMAIER-WACKER, L.; KIK, M.; KLINK, J.; KŘENOVÁ, J.; LAVAZZA, A.; LUEERT, S.; NOVÁKOVÁ, M.; ČEJKOVÁ, D.; PACIONI, C.; TROGU, T.; ŠMAJS, D.; ROOS, C. High prevalence and genetic diversity of Treponema paraluisleporidarum isolates in European lagomorphs. Microbiology spectrum, 2023, roč. 12, č. 1, ISSN: 2165-0497.
  Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

  SCHWARZEROVÁ, J.; LABANAVA, A.; RYCHLÍK, I.; VARGA, M.; ČEJKOVÁ, D. A minireview on the bioinformatics analysis of mobile gene elements in microbiome research. Frontiers in Bacteriology, 2023, roč. 2, č. 1, ISSN: 2813-6144.
  Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

  JANEČKOVÁ, K.; ROOS, C.; FEDROVÁ, P.; TOM, N.; ČEJKOVÁ, D.; LUEERT, S.; KEYYU, J.; CHUMA, I.; KNAUF, S.; ŠMAJS, D. The genomes of the yaws bacterium, Treponema pallidum subsp. pertenue, of nonhuman primate and human origin are not genomically distinct. PLOS NEGLECT TROP D, 2023, roč. 17, č. 9, ISSN: 1935-2735.
  Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

  SCHWARZEROVÁ, J.; ZEMAN, M.; BABÁK, V.; JUREČKOVÁ, K.; NYKRÝNOVÁ, M.; VARGA, M.; WECKWERTH, W.; DOLEJSKÁ, M.; PROVAZNÍK, V.; RYCHLÍK, I.; ČEJKOVÁ, D. Detecting horizontal gene transfer among microbiota: an innovative pipeline for identifying co-shared genes within the mobilome through advanced comparative analysis. Microbiology spectrum, 2023, roč. 12, č. 1, ISSN: 2165-0497.
  Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

  NEJEZCHLEBOVÁ, J.; SCHWARZEROVÁ, J.; ČEJKOVÁ, D. An insight into horizontal gene transfer in Bacteroidetes spp. using in-silico analysisof operon structures. Proceedings I of the 29th Conference STUDENT EEICT 2023 General papers. 1. Brno: Brno University of Technology, Faculty of Electrical Engineering and Communication, 2023. s. 210-213. ISBN: 978-80-214-6153-6.
  Detail | WWW

• 2022

  ČEJKOVÁ, D.; STREĎANSKÁ, K.; JUREČKOVÁ, K.; NYKRÝNOVÁ, M.; SCHWARZEROVÁ, J.; DOLEJSKÁ, M. Horizontal gene transfer network in chicken gut microbiome. 14th Host Pathogen Interaction Forum 2022. Hradec Kralove: 2022. ISBN: 978-80-906723-2-1.
  Detail

  SCHWARZEROVÁ, J.; ZEMAN, M.; WECKWERTH, W.; PROVAZNÍK, I.; RYCHLÍK, I.; ČEJKOVÁ, D. Comprehensive analysis of mobile genetic elements in chicken gut microbiome using a novel in-silico approach. 14th Host Pathogen Interaction Forum 2022. Hradec Kralove: 2022. ISBN: 978-80-906723-2-1.
  Detail

  SCHWARZEROVÁ, J.; ČEJKOVÁ, D. Identification of horizontal genes transfer elements across strains inhabiting the same niche using pan-genome analysis. In Proceedings I of the 28th Conference STUDENT EEICT 2022 General Papers. Brno: Brno University of Technology, Faculty of Electrical Engineering and Communication, 2022. s. 416-420. ISBN: 978-80-214-6029-4.
  Detail | WWW

  SCHWARZEROVÁ, J.; ZEMAN, M.; RYCHLÍK, I.; WECKWERTH, W.; PROVAZNÍK, I.; DOLEJSKÁ, M.; ČEJKOVÁ, D. Systems biology approach for analysis of mobile genetic elements in chicken gut microbiome. In 2022 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). IEEE Computer Society, 2022. s. 2865-2870. ISBN: 978-1-4577-1799-4.
  Detail | WWW

• 2021

  JUŘICOVÁ, H.; MATIAŠOVICOVÁ, J.; KUBASOVÁ, T.; ČEJKOVÁ, D.; RYCHLÍK, I. Distribuce genů rezistence k antibiotikům u komenzálních bakterií slepého střeva kura domácího. Veterinářství. Profi Press, s.r.o. GJ, 2021, roč. 71, č. 7, s. 411-414. ISSN: 0506-8231.
  Detail | WWW

  JUŘICOVÁ, H.; MATIAŠOVICOVÁ, J.; KUBASOVÁ, T.; ČEJKOVÁ, D.; RYCHLÍK, I. The distribution of antibiotic resistance genes in chicken gut microbiota commensals. Scientific Reports, 2021, roč. 11, č. 1, s. 1-10. ISSN: 2045-2322.
  Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

• 2015

  GERŽOVÁ, L.; BABÁK, V.; SEDLÁŘ, K.; FALDYNOVÁ, M.; VÍDEŇSKÁ, P.; ČEJKOVÁ, D.; NYGAARD JENSEN, A.; DENIS, M.; KEROUANTON, A.; RICCI, A.; CIBIN, V.; ÖSTERBERG, J.; RYCHLÍK, I. Characterization of antibiotic resistance gene abundance and microbiota composition in feces of organic and conventional pigs from four EU countries. PLOS ONE. USA: Plos, 2015. s. 1-10. ISSN: 1932-6203.
  Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

• 2014

  VÍDEŇSKÁ, P.; RAHMAN, M.; FALDYNOVÁ, M.; BABÁK, V.; MATULOVÁ, M.; PRUKNER-RADOVCIC, E.; KŘÍŽEK, I.; SMOLE-MOZINA, S.; KOVAC, J.; SZMOLKA, A.; NAGY, B.; SEDLÁŘ, K.; ČEJKOVÁ, D.; RYCHLÍK, I. Characterization of Egg Laying Hen and Broiler Fecal Microbiota in Poultry Farms in Croatia, Czech Republic, Hungary and Slovenia. PLOS ONE. California (US): Public Library of Science, 2014. s. e110076 (e110076 s.)ISSN: 1932-6203.
  Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

  VÍDEŇSKÁ, P.; SEDLÁŘ, K.; LUKAC, M.; FALDYNOVÁ, M.; GERŽOVÁ, L.; ČEJKOVÁ, D.; ŠIŠÁK, F.; RYCHLÍK, I. Succession and Replacement of Bacterial Populations in the Caecum of Egg Laying Hens over Their Whole Life. PLOS ONE. California (US): Public Library of Science, 2014. s. 1-14. ISSN: 1932-6203.
  Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně

*) Citace publikací se generují jednou za 24 hodin.