Ing.
Helena Vítková
Ph.D.
FEKT, UBMI – odborný asistent
+420 54114 6684
vitkovah@vut.cz
Publikace
2025
VÍTKOVÁ, H.; JAKUBÍČKOVÁ, M.; BEZDÍČEK KRÁLOVÁ, S. Consensus-Based Detection of Biosynthetic Gene Clusters with Application to RiPPs from Antartic Bacteria. ENBIK 2025, Karlov pod Pradědem. 2025.
DetailJAKUBÍČKOVÁ, M.; ŠABATOVÁ, K.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; VÍTKOVÁ, H. Streamlined workflow for bacterial methylation analysis using nanopore data. ENBIK 2025, Karlov pod Pradědem. 2025.
DetailJAKUBÍČKOVÁ, M.; ŠABATOVÁ, K.; ZBUDILOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; VÍTKOVÁ, H. Computational methylome analysis pipeline for uncovering DNA methylation sites in Klebsiella pneumoniae core genome. ESCMID Global 2025, Vienna, Austria. 2025.
DetailUMAIR, M.; JAKUBÍČKOVÁ, M.; BUCHTÍKOVÁ, I.; BEZDÍČEK, M.; OBRUČA, S.; VÍTKOVÁ, H.; SEDLÁŘ, K. Methylome Profiling Using Third-Generation Sequencing: A Comparison of PacBio and ONT in a PHA-Producing Bacterium. ENBIK 2025 conference proceedings. Prague: University of Chemistry and technology, 2025.
s. 73-73. ISBN: 978-80-7592-292-2.
DetailŠABATOVÁ, K.; JAKUBÍČKOVÁ, M.; ZBUDILOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; VÍTKOVÁ, H. MethylomeMiner: a simple tool for processing and analysing DNA methylation data from sequencing. ESCMID Global 2025, Vienna, Austria. 2025.
DetailŠABATOVÁ, K.; JAKUBÍČKOVÁ, M.; DZURČANINOVÁ, N.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; VÍTKOVÁ, H. User-friendly web tool for typing and characterization of ESKAPEE pathogens. ENBIK 2025, Karlov pod Pradědem. 2025.
Detail2024
NYKRÝNOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; VÍTKOVÁ, H. Design of a plasmid classification workflow for local bacterial population analysis. ESCMID Global 2024, Barcelona, Spain. 2024.
DetailJUGAS, R.; VÍTKOVÁ, H. ProcaryaSV: structural variation detection pipeline for bacterial genomes using short-read sequencing. BMC BIOINFORMATICS, 2024, roč. 25, č. 1,
s. 1-13. ISSN: 1471-2105.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovněNYKRÝNOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; VÍTKOVÁ, H. Exploring DNA Methylation Patterns in the Core Genome of Klebsiella pneumoniae. In Lecture Notes in Bioinformatics. Lecture Notes in Computer Science. 14849. Springer Nature, 2024.
s. 140-152. ISBN: 978-3-031-64636-2. ISSN: 1611-3349.
Detail | WWWVÍTKOVÁ, H.; NYKRÝNOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M. Unveiling Diversity: Classification of Klebsiella Pneumoniae Plasmids from Long-read Assemblies. In Lecture Notes in Bioinformatics. Lecture Notes in Computer Science. 14849. Springer Nature, 2024.
s. 314-328. ISBN: 978-3-031-64636-2. ISSN: 1611-3349.
Detail | WWW2023
NYKRÝNOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; DUFKOVÁ, K.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Hybrid mapping for plasmid content determination in NGS data. 33rd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases 2023, Copenhagen, Denmark. 2023.
DetailNYKRÝNOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Bacterial phenotype prediction based on methylation site profiles. In 2023 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB). IEEE, 2023.
s. 1-6. ISBN: 979-8-3503-1017-7.
Detail | WWW2022
JUREČKOVÁ, K.; NYKRÝNOVÁ, M.; SLANINOVÁ, E.; BEZDÍČEK, M.; OBRUČA, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; SEDLÁŘ, K. Genomic and functional analysis of polyhydroxyalkanoates producer Rhodospirillum rubrum DSM 467. In Proceedings of the 9th International Conference on Chemical Technology. Prague: Czech Society of Industrial Chemistry, 2022.
s. 367-372. ISBN: 978-80-88307-11-2.
Detail | WWWSEDLÁŘ, K.; MUSILOVÁ, J.; ŠKUTKOVÁ, H.; NYKRÝNOVÁ, M.; JUREČKOVÁ, K.; PERNICOVÁ, I.; SLANINOVÁ, E.; FLEURIOT-BLITMAN, H.; ZINN, M.; OBRUČA, S. Improving structural annotation of Rhodospirillum rubrum DSM 467 with RNA-Seq. 18th International Symposium on Biopolymers (ISBP). 2022.
DetailNYKRÝNOVÁ, M.; JUREČKOVÁ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; SLANINOVÁ, E.; OBRUČA, S.; FLEURIOT-BLITMAN, H.; ZINN, M.; SEDLÁŘ, K. Gene expression profiling in Rhodospirillum rubrum. 18th International Symposium on Biopolymers (ISBP). 2022.
DetailNYKRÝNOVÁ, M.; JAKUBÍČEK, R.; BARTOŇ, V.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Using deep learning for gene detection and classification in raw nanopore signals. Frontiers in Microbiology, 2022, roč. 13, č. 1,
s. 1-11. ISSN: 1664-302X.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovněNYKRÝNOVÁ, M.; JAKUBÍČEK, R.; BEZDÍČEK, M.; DUFKOVÁ, K.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Real-time MLST genes detection in nanopore squiggles. 32nd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases 2022, Lisbon, Portugal. 2022.
DetailBARTOŇ, V.; ŠKUTKOVÁ, H. Data Transformation for Clustering Utilization for Feature Detection in Mass Spectrometry. In Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics). 13347. Springer, 2022.
s. 288-299. ISBN: 978-3-031-07801-9.
Detail | WWWNYKRÝNOVÁ, M.; BARTOŇ, V.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Identification of highly variable sequence fragments in unmapped reads for rapid bacterial genotyping. BMC GENOMICS, 2022, roč. 23, č. SUPPL 3,
s. 1-12. ISSN: 1471-2164.
Detail | WWW2021
NYKRÝNOVÁ, M.; BARTOŇ, V.; VÍTEK, M.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Raw nanopore squiggle alignment for bacterial typing distinction enhancement. In 2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). 2021.
s. 1969-1974. ISBN: 978-1-6654-0126-5.
DetailBARTOŇ, V.; NYKRÝNOVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. MANASIG: Python Package to MAnipulateNAnopore SIGnals from sequencing files. In 2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). 2021.
s. 1941-1947. ISBN: 978-1-6654-0126-5.
DetailBEZDÍČEK, M.; NYKRÝNOVÁ, M.; SEDLÁŘ, K.; KRÁLOVÁ, S.; HANSLIKOVA, J.; KOMPRDOVÁ, A.; ŠKUTKOVÁ, H.; KOCMANOVÁ, I.; MAYER, J.; LENGEROVÁ, M. Rapid high-resolution melting genotyping scheme for Escherichia coli based on MLST derived single nucleotide polymorphisms. Scientific Reports, 2021, roč. 11, č. 1,
s. 1-11. ISSN: 2045-2322.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovněJUGAS, R.; SEDLÁŘ, K.; VÍTEK, M.; NYKRÝNOVÁ, M.; BARTOŇ, V.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. CNproScan: Hybrid CNV detection for bacterial genomes. GENOMICS, 2021, roč. 113, č. 5,
s. 3103-3111. ISSN: 0888-7543.
Detail | WWWSEDLÁŘ, K.; NYKRÝNOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; BRANSKÁ, B.; LENGEROVÁ, M.; PATÁKOVÁ, P.; ŠKUTKOVÁ, H. Diversity and Evolution of Clostridium beijerinckii and Complete Genome of the Type Strain DSM 791T. Processes, 2021, roč. 9, č. 7,
s. 1-16. ISSN: 2227-9717.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovněNYKRÝNOVÁ, M.; BARTOŇ, V.; SEDLÁŘ, K.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Word entropy-based approach to detect highly variable genetic markers for bacterial genotyping. Frontiers in Microbiology, 2021, roč. 12, č. 1,
s. 1-8. ISSN: 1664-302X.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovněMUSILOVÁ, J.; KOUŘILOVÁ, X.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; OBRUČA, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; SEDLÁŘ, K. First Complete Genome of the Thermophilic Polyhydroxyalkanoates Producing Bacterium Schlegelella thermodepolymerans DSM 15344. GENOME BIOL EVOL, 2021, roč. 13, č. 4,
s. 1-13. ISSN: 1759-6653.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovněNYKRÝNOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; STRNADOVÁ, M.; DUFKOVÁ, K.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Bacterial typing via raw nanopore signals. ECCMID 2021. Vienna, Austria: 2021.
Detail2020
BARTOŇ, V.; NYKRÝNOVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Watershed Segmentation for Peak Picking in Mass Spectrometry Data. In Bioinformatics and Biomedical Engineering. Lecture Notes in Computer Science. 2020.
s. 494-502. ISBN: 978-3-030-45384-8. ISSN: 0302-9743.
DetailNYKRÝNOVÁ, M.; BARTOŇ, V.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Detection of Highly Variable Genome Fragments in Unmapped Reads of Escherichia coli Genomes. In Bioinformatics and Biomedical Engineering. Lecture Notes in Computer Science. 2020.
s. 569-578. ISBN: 978-3-030-45384-8. ISSN: 0302-9743.
Detail2019
JUGAS, R.; VÍTEK, M.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; ŠKUTKOVÁ, H. Signal processing based CNV detection in bacterial genomes. In Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2019. Lecture Notes in Computer Science. Granada, Spain: Springer Verlag, 2019.
s. 93-102. ISBN: 978-3-030-17937-3. ISSN: 0302-9743.
Detail | WWWNYKRÝNOVÁ, M.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; BARTOŇ, V.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Entropy-Based Detection of Genetic Markers for Bacteria Genotyping. In Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2019. Lecture Notes in Computer Science. 2019.
s. 177-188. ISBN: 978-3-030-17934-2. ISSN: 0302-9743.
DetailBARTOŇ, V.; NYKRÝNOVÁ, M.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Clustering of Klebsiella Strains Based on Variability in Sequencing Data. In Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2019. Lecture Notes in Computer Science. 2019.
s. 189-199. ISBN: 978-3-030-17934-2. ISSN: 0302-9743.
DetailŠKUTKOVÁ, H.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; SEDLÁŘ, K.; JUGAS, R.; VÍTEK, M. A degeneration-reducing criterion for optimal digital mapping of genetic codes. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2019, roč. 17, č. 1,
s. 406-414. ISSN: 2001-0370.
Detail | WWWŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; BEZDÍČEK, M.; BRHELOVÁ, E.; LENGEROVÁ, M. Advanced DNA fingerprint genotyping based on a model developed from real chip electrophoresis data. Journal of Advanced Research, 2019, roč. 18, č. 18,
s. 9-18. ISSN: 2090-1232.
Detail | WWWMADĚRÁNKOVÁ, D.; JUGAS, R.; SEDLÁŘ, K.; VÍTEK, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Rapid bacterial species delineation based on parameters derived from genome numerical representations. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2019, roč. 17, č. 1,
s. 118-126. ISSN: 2001-0370.
Detail | WWWNYKRÝNOVÁ, M.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; BEZDÍČEK, M.; LENGEROVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Bioinformatic Tools for Genotyping of Klebsiella pneumoniae Isolates. In Information Technology in Biomedicine. 2019.
s. 419-428. ISBN: 978-3-319-91210-3.
Detail | WWWBARTOŇ, V.; ŠKUTKOVÁ, H. Watershed Segmentation for Peak Picking of High-Resolution Mass Spectrometry Data. In Proceedings of IEEE Student Branch Conference Mikulov2019. Brno: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, 2019.
s. 23-25. ISBN: 978-80-214-5781-2.
DetailNYKRÝNOVÁ, M.; ŠKUTKOVÁ, H. Method for improving the consensus sequence from NGS data based on reads classification. In Proceedings of IEEE Student Branch Conference Mikulov 2019. Brno: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, 2019.
s. 6-9. ISBN: 978-80-214-5781-2.
Detail | WWWJUGAS, R.; SEDLÁŘ, K.; VÍTEK, M.; ŠKUTKOVÁ, H. CNV Hybrid Detection in Bacteria Using Signal Processing. International Conference of the Genetics Society of Korea 2019 : New Horizons of Genetics. 1. Seoul, Republic of Korea: The Genetics Society of Korea, 2019.
s. 101-101.
Detail | WWW2018
JUGAS, R.; VÍTEK, M.; SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H. Cross-Correlation Based Detection of Contigs Overlaps. In MIPRO 2018 proceedings. New York: IEEE, 2018.
s. 155-158. ISBN: 978-953-233-095-3.
Detail | WWW2017
JUGAS, R.; SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M. Overlap detection for a genome assembly based on genomic signal processing. In 2017 IEEE 30th International Symposium on Computer-Based Medical Systems. Proceedings of the ... IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems. USA: IEEE Computer Society, 2017.
s. 301-305. ISBN: 978-1-5386-1710-6. ISSN: 2372-9198.
Detail | WWWMADĚRÁNKOVÁ, D.; SEDLÁŘ, K.; VÍTEK, M.; ŠKUTKOVÁ, H. The identification of replication origin in bacterial genomes by cumulated phase signal. In 2017 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB). IEEE, 2017.
s. 267-271. ISBN: 978-1-4673-8988-4.
Detail | WWW2016
SEDLÁŘ, K.; VÍDEŇSKÁ, P.; ŠKUTKOVÁ, H.; RYCHLÍK, I.; PROVAZNÍK, I. Bipartite Graphs for Visualization Analysis of Microbiome Data. EVOLUTIONARY BIOINFORMATICS, 2016, roč. 12, č. S1,
s. 17-23. ISSN: 1176-9343.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně2015
SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; KOLEK, J.; PATÁKOVÁ, P.; PROVAZNÍK, I. Bacterial Genome Assembly in Biotechnology: Clostridium Pasteurianum NRRL B- 598 Genome. 3. mezinárodní chemicko- technologická konference, SBORNÍK ABSTRAKT A PLNÝCH TEXTŮ. Mikulov: Academic and Medical Conference Agency, 2015.
s. 1 (1 s.). ISBN: 978-80-86238-73- 9.
DetailSEDLÁŘ, K.; KOLEK, J.; ŠKUTKOVÁ, H.; BRANSKÁ, B.; PROVAZNÍK, I.; PATÁKOVÁ, P. Complete genome sequence of Clostridium pasteurianum NRRL B-598, a non-type strain producing butanol. Journal of Biotechnology, 2015, roč. 214, č. 1,
s. 113-114. ISSN: 0168-1656.
DetailSEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍDEŇSKÁ, P.; RYCHLÍK, I.; PROVAZNÍK, I. Bipartite Graphs for Metagenomic Data Analysis and Visualization. In Proceedings 2015 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2015). 1. Washington D.C.: IEEE, 2015.
s. 1123-1128. ISBN: 978-1-4673-6798-1.
Detail | WWWŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; SEDLÁŘ, K.; PROVAZNÍK, I. Progressive alignment of genomic signals by multiple dynamic time warping. Journal of Theoretical Biology, 2015, roč. 2015, č. 385,
s. 20-30. ISSN: 0022-5193.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovněSEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I. Set of rules for genomic signal downsampling. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, 2015, roč. 64, č. p1,
s. 1-7. ISSN: 0010-4825.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně2014
SEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I. Prokaryotic DNA Signal Downsampling for Fast Whole Genome Comparison. Advances in Intelligent Systems and Computing, 2014, roč. 283, č. 6,
s. 373-383. ISSN: 2194-5357.
DetailSEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; KOLEK, J.; PATÁKOVÁ, P.; PROVAZNÍK, I. Bioinformatics for biotechnology research: data mining of Clostridium pasteurianum genome. BioTech 2014 and 6th Czech- Swiss Symposium with Exhibition Book of Abstracts. 1. Praha: Institute of Chemical Technology Prague, 2014.
s. 64-64. ISBN: 978-80-7080-887- 0.
DetailKOLEK, J.; SEDLÁŘ, K.; BRANSKÁ, B.; ŠKUTKOVÁ, H.; LINHOVÁ, M.; PROVAZNÍK, I.; MELZOCH, K.; PATÁKOVÁ, P. Clostridium pasteurianum NRRL B-598 Phenotype Matching Genotype?. Clostridium XIII book of abstracts. Shangai, China: 2014.
s. 69-69.
Detail | WWWSOCHOR, J.; JUŘÍKOVÁ, T.; POHANKA, M.; ŠKUTKOVÁ, H.; BAROŇ, M.; TOMÁŠKOVÁ, L.; BALLA, Š.; KLEJDUS, B.; POKLUDA, R.; MLČEK, J.; TROJÁKOVÁ, Z.; ŠALOUN, J. Evaluation of Antioxidant Activity, Polyphenolic Compounds, Amino Acids and Mineral Elements of Representative Genotypes of Lonicera edulis. MOLECULES, 2014, roč. 19, č. 5,
s. 6505-6523. ISSN: 1420-3049.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovněŠKUTKOVÁ, H.; BABULA, P.; PROVAZNÍK, I. Bioinformatic study of genetic variability of superoxide dismutase isoforms. In 2. mezinárodní chemicko-technologická konference, SBORNÍK ABSTRAKT A PLNÝCH TEXTŮ. Mikulov: 2014.
s. 1-6. ISBN: 978-80-86238-61- 6.
DetailSEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; KOLEK, J.; PATÁKOVÁ, P.; PROVAZNÍK, I. Identification and Characterization of Sol Operon in Clostridium Pasteurianum NRRL B- 598 Genome. In 2. mezinárodní chemicko-technologická konference, SBORNÍK ABSTRAKT A PLNÝCH TEXTŮ. 1. Mikulov: 2014.
s. 1-5. ISBN: 978-80-86238-61- 6.
Detail2013
ŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; PROVAZNÍK, I. Celogenomové srovnání organismů pomocí signálového zpracování. In Trendy v biomedicínskom inžinierstve 2013. 2013.
s. 1-5. ISBN: 978-80-8086-208- 4.
DetailŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; BABULA, P.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Classification of genomic signals using dynamic time warping. BMC BIOINFORMATICS, 2013, roč. 14, č. 10,
s. 1-7. ISSN: 1471- 2105.
Detail | WWWSEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I. Compressed DNA signal representation for classification of long sequences. In XIII pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. 1. Brno: LITERA BRNO, 2013.
s. 135-136. ISBN: 978-80-7375-757- 1.
DetailŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; KŘÍŽKOVÁ, S.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Preprocessing and Classification of Electrophoresis Gel Images Using Dynamic Time Warping. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2013, roč. 2013(8), č. 2,
s. 1609-1620. ISSN: 1452- 3981.
DetailZÍTKA, O.; KOMÍNKOVÁ, M.; SKALIČKOVÁ, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; ECKSCHLAGER, T.; STIBOROVÁ, M.; TRNKOVÁ, L.; ADAM, V.; KIZEK, R. Single Amino Acid Change in Metallothionein Metal-Binding Cluster Influences Interaction with Cisplatin. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2013, roč. 8, č. 2,
s. 2625-2634. ISSN: 1452-3981.
Detail2012
BABULA, P.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; ECKSCHLAGER, T.; STIBOROVÁ, M.; TRNKOVÁ, L.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Mammalian metallothioneins: properties and functions. METALLOMICS, 2012, roč. 4, č. 1,
s. 739-750. ISSN: 1756-5901.
DetailSOCHOR, J.; SALAŠ, P.; ŠKUTKOVÁ, H.; BABULA, P.; PROVAZNÍK, I.; ADAM, V.; KIZEK, R. Environmental monitoring of soil conditioner effects on photosynthetic parameters of Acer campestre L. AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2012, roč. 11, č. 58,
s. 4007-4021. ISSN: 1684- 5315.
DetailVACULOVIČOVÁ, M.; HYNEK, D.; ŠKUTKOVÁ, H.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Structural changes in metallothionein isoforms revealed by capillary electrophoresis and Brdicka reaction. Electrophoresis, 2012, roč. 33, č. 2,
s. 270-279. ISSN: 0173-0835.
DetailBABULA, P.; VODIČKA, O.; ADAM, V.; KUMMEROVÁ, M.; HAVEL, L.; HOŠEK, J.; PROVAZNÍK, I.; ŠKUTKOVÁ, H.; BEKLOVÁ, M.; KIZEK, R. Effect of fluoranthene on plant cell model: Tobacco BY- 2 suspension culture. ENVIRONMENTAL AND EXPERIMENTAL BOTANY, 2012, roč. 2012, č. 78,
s. 117-126. ISSN: 0098- 8472.
DetailŠMERKOVÁ, K.; DOSTÁLOVÁ, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; VACULOVIČOVÁ, M.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Isolation of Xis Gen Fragment of lambda Phage from Agarose Gel Using Magnetic Particles for Subsequent Enzymatic DNA Sequencing. CHROMATOGRAPHIA, 2012, roč. 2012, č. 10,
s. 1-6. ISSN: 0009-5893.
DetailŠKUTKOVÁ, H.; BABULA, P.; STIBOROVÁ, M.; ECKSCHLAGER, T.; TRNKOVÁ, L.; PROVAZNÍK, I.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R.; ADAM, V. Structure, Polymorphisms and Electrochemistry of Mammalian Metallothioneins – A Review. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2012, roč. 2012, č. 7,
s. 12415-12431. ISSN: 1452- 3981.
DetailZÍTKA, O.; KOMÍNKOVÁ, M.; SKALIČKOVÁ, S.; ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; ECKSCHLAGER, T.; STIBOROVÁ, M.; ADAM, V.; TRNKOVÁ, L.; KIZEK, R. Hydrodynamic Voltammograms Profiling of Metallothionein Fragment. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2012, roč. 7, č. 11,
s. 10544-10561. ISSN: 1452- 3981.
DetailPROVAZNÍK, I.; KUBICOVÁ, V.; ŠKUTKOVÁ, H.; NEDVĚD, J.; TKACZ, E.; BABULA, P.; KIZEK, R. Detection of Short Exons in DNA Sequences Using Complex Wavelet Transform of Structural Features. In Proceedings of IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics 2012. 2012.
s. 1-4. ISBN: 978-1-4673-0491- 7.
DetailSEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H. Predikce sekundární struktury proteinů pomocí neuronové sítě. In Sborní z konference: Student EEICT 2012. Brno: VUT Brno, 2012.
s. 1-3. ISBN: 978-80-214-4462- 1.
DetailŠKUTKOVÁ, H.; VÍTEK, M.; KIZEK, R.; PROVAZNÍK, I. Preprocessing and classification of electroforetic gel image using dynamic time warping. In Sborník - XII. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: Mendelova univerzita v Brně, 2012.
s. 280-282. ISBN: 978-80-7375-618- 5.
Detail2011
TRNKOVÁ, L.; HÚSKA, D.; ŠKUTKOVÁ, H.; BEKLOVÁ, M.; HUBÁLEK, J.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Paramagnetic antibody- modified microparticles coupled with voltammetry as a tool for isolation and detection of metallothionen as a bioindicator of metal pollution. JOURNAL OF ENVIRONMENTAL MONITORING, 2011, roč. 2011, č. 13,
s. 2763-2769. ISSN: 1464- 0325.
DetailŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Influence of sample variance on the phylogenetic reconstruction of protein sequences. In ACM digital library: Proceedings of 4th International Symposium on Applied Sciences in Biomedical and Communication Technologies. 2011.
s. 1-5. ISBN: 978-1-4503-0913- 4.
DetailSOCHOR, J.; ŠKUTKOVÁ, H.; BABULA, P.; ZÍTKA, O.; CERNEI, N.; ROP, O.; KRŠKA, B.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Mathematical evaluation of the amino acid and polyphenol content and antioxidant activities of fruits from different apricot cultivars. MOLECULES, 2011, roč. 16, č. 9,
s. 7428-7457. ISSN: 1420-3049.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovněMADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I.; ŠKUTKOVÁ, H. Výukové aplikace pro zpracování genomických dat v bioinformatických předmětech. In Trendy v biomedicínském inženýrství 2011. Ostrava: 2011.
s. 56-58. ISBN: 978-80-248-2475- 8.
DetailSEDLÁŘ, K.; SMERKOVÁ, K.; ŠKUTKOVÁ, H.; SOCHOR, J.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. DPPH aqueous antioxidant assay solution. In XI. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: 2011.
s. 250-254. ISBN: 978-80-7375-514- 0.
DetailZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; ADAM, V.; TRNKOVÁ, L.; BABULA, P.; HUBÁLEK, J.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. A New Approach how to Define the Coefficient of Electroactivity of Adenine and Its Twelve Derivatives Using Flow Injection Analysis with Amperometric Detection. ELECTROANALYSIS, 2011, roč. 23, č. 7,
s. 1556-1567. ISSN: 1040-0397.
DetailZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; KRYŠTOFOVÁ, O.; ŠOBROVÁ, P.; ADAM, V.; ZEHNÁLEK, J.; BEKLOVÁ, M.; HUBÁLEK, J.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Rapid and Ultrasensitive Method for Determination of Phytochelatin2 using High Performance Liquid Chromatography with Electrochemical Detection. INTERNATIONAL JOURNAL OF ELECTROCHEMICAL SCIENCE, 2011, roč. 2011 (6), č. 5,
s. 1367-1381. ISSN: 1452-3981.
DetailSEDLÁŘ, K.; ŠKUTKOVÁ, H. Bootstrap consensus tree in phylogeny reconstruction. In Sborník soutěže Student EEICT 2011. Brno: VUT v Brně, 2011.
s. 130-132. ISBN: 978-80-214-4271- 9.
DetailZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; MAJZLÍK, P.; MASAŘÍK, M.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; HUBÁLEK, J.; KIZEK, R. Analytické nástroje pro sledování komplexů platiny. In XXXV. Brněnské onkologické dny. Brno: Masarykův onkologický ústav, 2011.
s. 334-335. ISBN: 978-80-86793-17- 7.
DetailŠKUTKOVÁ, H.; MADĚRÁNKOVÁ, D.; PROVAZNÍK, I. Výuka molekulární fylogenetiky v bioinformatických předmětech. In Sborník konference Trendy v Biomedicínském inženýrství 2011. VŠB - Technická univerzita Ostrava, 2011.
s. 52-55. ISBN: 978-80-248-2475- 8.
Detail2010
ŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Fylogenetická stromová struktura vybraných sub- rodin metallothioneinů. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Muni Press, 2010.
s. 77-78. ISBN: 978-80-210-5164- 5.
DetailŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Relationships Of Bacterial Metallothioneins Analyses: Phylogenetic Tree Construction Method. In Analysis of Biomedical Signals and Images. Analysis of Biomedical Signals and Images. Brno: VUT v Brně, 2010.
s. 1-6. ISBN: 978-80-214-4106- 4. ISSN: 1211- 412X.
DetailŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Mutual Similarity of Aminoacid Sequences in Family of Metallothioneins. In Sborník příspěvků. MUNI Brno, 2010.
s. 211-212. ISBN: 978-80-7375-396- 2.
DetailSOCHOR, J.; ZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; PAVLÍK, D.; BABULA, P.; KRŠKA, B.; HORNA, A.; ADAM, V.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Content of phenolic compounds and antioxidant capacity in fruits of selected genotypes of apricot with resistance against Plum pox virus. MOLECULES, 2010, roč. 2010, č. 15,
s. 6285-6305. ISSN: 1420-3049.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovněŠKUTKOVÁ, H.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Similarity analysis of primary and secondary structures of metallothioneins. In The 10th IEEE International Conference on Information Technology and Applications in Biomedicine: Emerging Technologies for Patient Specific Healthcare. Corfu: IEEE, 2010.
s. 1-4. ISBN: 978-1-4244-6560- 6.
DetailROP, O.; SOCHOR, J.; JUŘÍKOVÁ, T.; ZÍTKA, O.; ŠKUTKOVÁ, H.; MLČEK, J.; SALAŠ, P.; KRŠKA, B.; BABULA, P.; ADAM, V.; KRAMÁŘOVÁ, D.; BEKLOVÁ, M.; PROVAZNÍK, I.; KIZEK, R. Effect of five different stages of ripening on chemical compounds in medlar (Mespilus germanica L.). MOLECULES, 2010, roč. 16, č. 1,
s. 74-91. ISSN: 1420-3049.
Detail | WWW | Plný text v Digitální knihovně
*) Citace publikací se generují jednou za 24 hodin.