Detail oboru
Bioinformatika a biocomputing
FITZkratka: MBIAk. rok: 2020/2021
Program: Informační technologie
Délka studia: 2 roky
Akreditace od: 1.1.2005Akreditace do: 31.12.2024
Profil
Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.
Klíčové výsledky učení
Student oboru získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti v oboru bioinformatiky a počítání podle přírody a získá tak potřebné znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování problémů biologických databází, algoritmů pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky, využití technik počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení.
Garant
Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)
Zkratka | Název | J. | Kr. | Pov. | Uk. | Hod. rozsah | Sk. | Ot. |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
BIO | Biometrické systémy | cs, en | 5 | Povinný | zá,zk | P - 39 / L - 6 / PR - 7 | ano | |
MAT | Matematické struktury v informatice | cs, en | 5 | Povinný | zk | P - 39 / COZ - 13 | ne | |
BC_MOG1 | Molekulární genetika I | cs | 3 | Povinný | zk | P - 26 | ano | |
PDB | Pokročilé databázové systémy | cs, en | 5 | Povinný | zá,zk | P - 26 / COZ - 6 / Cp - 6 / PR - 14 | ano | |
TIN | Teoretická informatika | cs | 7 | Povinný | zá,zk | P - 39 / COZ - 26 / PR - 13 | ano |
Zkratka | Název | J. | Kr. | Pov. | Uk. | Hod. rozsah | Sk. | Ot. |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
BIF | Bioinformatika | cs | 5 | Povinný | zk | P - 26 / Cp - 12 / PR - 14 | ano | |
BIN | Biologií inspirované počítače | cs | 5 | Povinný | zk | P - 26 / Cp - 8 / PR - 18 | ano | |
PRL | Paralelní a distribuované algoritmy | cs | 5 | Povinný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | ano | |
PP1 | Projektová praxe 1 | cs, en | 5 | Volitelný | kl | PR - 52 | ano |
Zkratka | Název | J. | Kr. | Pov. | Uk. | Hod. rozsah | Sk. | Ot. |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PBI | Pokročilá bioinformatika | cs | 4 | Povinný | zk | P - 20 / Cp - 13 / PR - 6 | ano | |
SEP | Semestrální projekt | cs, en | 5 | Povinný | kl | PR - 65 | ano | |
SFC | Soft Computing | cs | 5 | Povinný | zá,zk | P - 26 / PR - 26 | ano | |
THE | Teorie her | cs | 5 | Povinný | zá,zk | P - 26 / PR - 26 | ano | |
ZZN | Získávání znalostí z databází | cs | 5 | Povinný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | ano | |
PP2 | Projektová praxe 2 | cs | 5 | Volitelný | kl | PR - 52 | ano |
Zkratka | Název | J. | Kr. | Pov. | Uk. | Hod. rozsah | Sk. | Ot. |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DIP | Diplomová práce | cs, en | 13 | Povinný | zá | PR - 169 | ano |
Zkratka | Název | J. | Kr. | Pov. | Uk. | Hod. rozsah | Sk. | Ot. |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
HSC | Hardware/Software Codesign | cs, en | 5 | Povinně volitelný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | Hardware a sítě | ano |
PCS | Pokročilé číslicové systémy | cs | 5 | Povinně volitelný | zk | P - 26 / Cp - 10 / PR - 16 | Hardware a sítě | ano |
JA3 | Anglická konverzace na aktuální témata | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá,zk | COZ - 26 | Humanitní předmět | ano |
FCE | Angličtina: praktický kurz obchodní konverzace a prezentace | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | COZ - 26 | Humanitní předmět | ano |
AEU | Angličtina pro Evropu | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá,zk | COZ - 26 | Humanitní předmět | ano |
FIT | Dějiny a filozofie techniky | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | P - 26 | Humanitní předmět | ano |
FIK | Filozofie a kultura | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | P - 26 | Humanitní předmět | ne |
HKO | Manažerská komunikace a prezentace | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | COZ - 26 | Humanitní předmět | ano |
HVR | Manažerské vedení lidí a řízení času | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | COZ - 26 | Humanitní předmět | ano |
PRM | Právní minimum | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | P - 26 | Humanitní předmět | ano |
RET | Rétorika | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | P - 26 | Humanitní předmět | ano |
AGS | Agentní a multiagentní systémy | cs | 5 | Povinně volitelný | zk | P - 26 / Cp - 13 / PR - 13 | Moderní umělá inteligence | ano |
SIN | Inteligentní systémy | cs | 5 | Povinně volitelný | zk | P - 26 / PR - 26 | Moderní umělá inteligence | ano |
BIS | Bezpečnost informačních systémů | cs | 5 | Povinně volitelný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | Operační systémy a bezpečnost | ano |
ZPJa | Zpracování přirozeného jazyka (v angličtině) | en | 5 | Povinně volitelný | zk | P - 26 / PR - 26 | Zpracování dat a signálů | ne |
AIS | Analýza a návrh informačních systémů | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | ano | |
AVS | Architektury výpočetních systémů | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / Cp - 12 / PR - 14 | ano | |
BMS | Bezdrátové a mobilní sítě | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | ano | |
EIP | Ekonomie informačních produktů | cs | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / COZ - 6 / Cp - 12 / PR - 8 | ne | |
GZN | Grafická a zvuková rozhraní a normy | cs | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / Cp - 12 / PR - 14 | ano | |
GJA | Grafická uživatelská rozhraní v Javě | cs, en | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / PR - 26 | ano | |
GUX | Grafická uživatelská rozhraní v X Window | cs | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / PR - 26 | ne | |
GMU | Grafické a multimediální procesory | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / Cp - 8 / PR - 18 | ano | |
GAL | Grafové algoritmy | cs, en | 5 | Volitelný | zk | P - 39 / PR - 13 | ano | |
PGR | Počítačová grafika | cs, en | 5 | Volitelný | zk | P - 39 / Cp - 6 / PR - 7 | ano | |
POVa | Počítačové vidění (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / PR - 26 | ano | |
PGPa | Pokročilá počítačová grafika (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / PR - 26 | ano | |
PKS | Pokročilé komunikační systémy | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 39 / L - 6 / PR - 7 | ano | |
PDI | Prostředí distribuovaných aplikací | cs, en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / Cp - 6 / PR - 20 | ano | |
ROBa | Robotika (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / L - 6 / PR - 20 | ano | |
SEM | Senzory a měření | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / COZ - 6 / L - 6 / PR - 14 | ano | |
C1P | Směrování v rozsáhlých sítích (ROUTE) | cs | 5 | Volitelný | kl | L - 52 | ano | |
SAV | Statická analýza a verifikace | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | ano | |
SRI | Strategické řízení informačních systémů | cs | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / COZ - 2 / Cp - 4 / PR - 20 | ano | |
RTSa | Systémy pracující v reálném čase (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / Cp - 10 / PR - 16 | ano | |
TAMa | Tvorba aplikací pro mobilní zařízení (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | kl | P - 26 / PR - 26 | ano | |
VYPa | Výstavba překladačů (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | zk | P - 39 / PR - 13 | ano | |
VIN | Výtvarná informatika | cs | 5 | Volitelný | kl | P - 26 / PR - 26 | ano | |
ZPX | Zahraniční odborná praxe | en | 5 | Volitelný | zá | PR - 52 | ano |
Zkratka | Název | J. | Kr. | Pov. | Uk. | Hod. rozsah | Sk. | Ot. |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NAV | Návrh vestavěných systémů | cs | 5 | Povinně volitelný | zk | P - 26 / L - 16 / PR - 10 | Hardware a sítě | ano |
PPP | Praktické paralelní programování | cs | 5 | Povinně volitelný | zá,zk | P - 26 / Cp - 16 / PR - 10 | Hardware a sítě | ano |
PDS | Přenos dat, počítačové sítě a protokoly | cs, en | 5 | Povinně volitelný | zk | P - 39 / COZ - 4 / L - 2 / PR - 26 | Hardware a sítě | ano |
JA3 | Anglická konverzace na aktuální témata | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá,zk | COZ - 26 | Humanitní předmět | ano |
AEU | Angličtina pro Evropu | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá,zk | COZ - 26 | Humanitní předmět | ano |
FIT | Dějiny a filozofie techniky | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | P - 26 | Humanitní předmět | ne |
FIK | Filozofie a kultura | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | P - 26 | Humanitní předmět | ano |
HKO | Manažerská komunikace a prezentace | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | COZ - 26 | Humanitní předmět | ano |
HVR | Manažerské vedení lidí a řízení času | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | COZ - 26 | Humanitní předmět | ano |
PRM | Právní minimum | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | P - 26 | Humanitní předmět | ano |
RET | Rétorika | cs, en | 3 | Povinně volitelný | zá | P - 26 | Humanitní předmět | ano |
EVO | Aplikované evoluční algoritmy | cs | 5 | Povinně volitelný | zk | P - 26 / Cp - 12 / PR - 14 | Moderní umělá inteligence | ano |
SNT | Simulační nástroje a techniky | cs | 5 | Povinně volitelný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | Moderní umělá inteligence | ano |
KRY | Kryptografie | cs | 5 | Povinně volitelný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | Operační systémy a bezpečnost | ano |
NSB | Návrh, správa a bezpečnost | cs | 5 | Povinně volitelný | zá,zk | P - 26 / L - 12 / PR - 6 | Operační systémy a bezpečnost | ano |
POS | Pokročilé operační systémy | cs | 5 | Povinně volitelný | zk | P - 39 / PR - 13 | Operační systémy a bezpečnost | ne |
KKO | Kódování a komprese dat | cs | 5 | Povinně volitelný | zá,zk | P - 26 / PR - 26 | Zpracování dat a signálů | ano |
ZRE | Zpracování řečových signálů | cs, en | 5 | Povinně volitelný | zk | P - 26 / COZ - 2 / Cp - 12 / PR - 12 | Zpracování dat a signálů | ano |
MBA | Analýza systémů založená na modelech | cs | 5 | Volitelný | zk | P - 39 / Cp - 6 / PR - 7 | ano | |
BZA | Bezpečná zařízení | cs | 5 | Volitelný | zk | P - 39 / PR - 13 | ano | |
CSOa | CCNA Kybernetická bezpečnost (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | kl | P - 26 / L - 26 | ano | |
DFAa | Digitální forenzní analýza (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / L - 13 / PR - 13 | ano | |
DJA | Dynamické jazyky | cs | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / PR - 26 | ano | |
FLP | Funkcionální a logické programování | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / Cp - 12 / PR - 14 | ano | |
FVS | Funkční verifikace číslicových systémů | cs | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / L - 8 / PR - 18 | ano | |
FYO | Fyzikální optika | cs, en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / COZ - 13 / PR - 13 | ano | |
GIS | Geografické informační systémy | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / Cp - 10 / PR - 16 | ne | |
WAP | Internetové aplikace | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | ano | |
LOG | Logika | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / COZ - 26 | ano | |
MPR | Management projektů | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / COZ - 4 / Cp - 2 / PR - 20 | ano | |
MPC-MAT | Maticový a tenzorový počet | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / CPP - 18 / PR - 8 | ano | |
MUL | Multimédia | cs, en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / Cp - 13 / PR - 13 | ano | |
OPM | Optimalizace | cs | 4 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / Cp - 13 | ano | |
PIS | Pokročilé informační systémy | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 39 / PR - 13 | ano | |
PMA | Projektový manažer | cs | 5 | Volitelný | kl | P - 26 / COZ - 26 | ano | |
SLOa | Složitost (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / PR - 26 | ano | |
SSP | Stochastické procesy | cs | 4 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / CPP - 13 | ano | |
MPC-SYS | Systémová biologie | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / Cp - 26 | ano | |
SPP | Systémy odolné proti poruchám | cs | 5 | Volitelný | zá,zk | P - 26 / PR - 26 | ano | |
UXIa | Uživatelská zkušenost a návrh rozhraní a služeb (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | kl | P - 16 / COZ - 10 / PR - 26 | ano | |
VIZa | Vizualizace a CAD (v angličtině) | en | 5 | Volitelný | kl | P - 26 / Cp - 12 / PR - 14 | ano | |
VYF | Výpočetní fotografie | cs | 5 | Volitelný | kl | P - 26 / PR - 26 | ano | |
VGE | Výpočetní geometrie | cs, en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / PR - 26 | ano | |
VNV | Vysoce náročné výpočty | cs, en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / Cp - 26 | ano | |
ZPX | Zahraniční odborná praxe | en | 5 | Volitelný | zá | PR - 52 | ano | |
ZPO | Zpracování obrazu | cs, en | 5 | Volitelný | zk | P - 26 / PR - 26 | ano |
Všechny skupiny volitelných předmětů | ||
---|---|---|
Sk. | Počet předm. | Předměty |
Hardware a sítě | 1 - 9 | HSC, PCS, NAV, PPP, PDS |
Humanitní předmět | 1 | JA3 zimní/letní sem., FCE, AEU zimní/letní sem., FIT zimní/letní sem., FIK zimní/letní sem., HKO zimní/letní sem., HVR zimní/letní sem., PRM zimní/letní sem., RET zimní/letní sem. |
Moderní umělá inteligence | 1 - 9 | AGS, SIN, EVO, SNT |
Operační systémy a bezpečnost | 1 - 9 | BIS, KRY, NSB, POS |
Zpracování dat a signálů | 1 - 9 | ZPJa, KKO, ZRE |