Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

FITZkratka: MBIAk. rok: 2014/2015

Program: Informační technologie

Délka studia: 2 roky

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení

Student oboru získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti v oboru bioinformatiky a počítání podle přírody a získá tak potřebné znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování problémů biologických databází, algoritmů pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky, využití technik počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení.

Profesní profil absolventů s příklady


  • Absolventi mají pokročilé znalosti bioinformatiky, počítání podle přírody (natural computing) a orientují se v principech molekulární genetiky. Dovedou využívat biologické databáze, používat, vytvářet a akcelerovat algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Dokáží aplikovat techniky počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení a tím dosáhnout vylepšení jejich parametrů. 
  • Absolventi mají hluboké teoretické a praktické znalosti v oboru informačních technologií, a to zejména v oblastech pokročilých databázových systémů, teoretické informatiky, hardware/software codesignu a paralelních a distribuovaných algoritmů.
  • Absolventi jsou připraveni pro projektování, provoz a správu bioinformatických počítačových systémů. Jsou schopni aplikovat biologií inspirované metody při návrhu i realizaci výpočetních systémů. Jsou schopni navrhnout a provést experiment, analyzovat a interpretovat data, pracovat samostatně i v týmu, prezentovat výsledky a dále se vzdělávat jak v informatice tak i biologii. 
  • Možné uplatnění je v profesích jako projektant nebo správce bioinformatických počítačových systémů používaných v biotechnologických firmách, zdravotnictví, kriminalistice apod. Absolvent oboru dále uplatní získané vzdělání ve vývojových a výzkumných odděleních firem a institucí zabývajících se vývojem bionformatických systémů nebo výpočetních systémů, které využívají prvky moderní umělé inteligence.

Garant


Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)

1. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIOBiometrické systémycs, en5Povinnýano
MATMatematické struktury v informaticecs, en5Povinnýano
MOGMolekulární genetikacs3Povinnýano
PDBPokročilé databázové systémycs, en5Povinnýano
TINTeoretická informatikacs5Povinnýano
STISeminář teoretické informatikycs2Volitelnýano
1. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIFBioinformatikacs5Povinnýano
BINBiologií inspirované počítačecs5Povinnýano
PRLParalelní a distribuované algoritmycs5Povinnýano
2. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
PBIPokročilá bioinformatikacs4Povinnýano
SEPSemestrální projektcs, en5Povinnýano
SFCSoft Computingcs5Povinnýano
THETeorie hercs4Povinnýano
ZZNZískávání znalostí z databázícs5Povinnýano
2. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
DIPDiplomový projektcs, en13Povinnýano
Libovolný ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AEUAngličtina pro Evropucs3Povinně volitelnýano
FCEAngličtina: příprava na zkoušku FCEcs3Povinně volitelnýano
BISBezpečnost informačních systémůcs5Povinně volitelnýano
FITDějiny a filozofie technikycs3Povinně volitelnýano
HSCHardware/Software Codesigncs, en5Povinně volitelnýano
SINInteligentní systémycs5Povinně volitelnýano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelnýano
PCSPokročilé číslicové systémycs5Povinně volitelnýano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelnýano
HPOPsychologie osobnostics3Povinně volitelnýano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelnýano
AISAnalýza a návrh informačních systémůcs5Volitelnýano
ACHArchitektura procesorůcs5Volitelnýano
BMSBezdrátové a mobilní sítěcs5Volitelnýano
EIPEkonomie informačních produktůcs5Volitelnýano
FAVFormální analýza a verifikacecs5Volitelnýano
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normycs5Volitelnýano
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Windowcs5Volitelnýano
GMUGrafické a multimediální procesorycs5Volitelnýano
GALGrafové algoritmycs, en5Volitelnýano
SENInteligentní senzorycs5Volitelnýano
KRGKreativní grafikacs4Volitelnýano
MOBModelování biologických systémůcs4Volitelnýano
OPMOptimalizacecs4Volitelnýano
PGRPočítačová grafikacs, en5Volitelnýano
POVPočítačové viděnícs5Volitelnýano
PGPPokročilá počítačová grafikacs5Volitelnýano
PKSPokročilé komunikační systémycs5Volitelnýano
PDIProstředí distribuovaných aplikacícs, en5Volitelnýano
ROSReal-time operační systémycs5Volitelnýano
ROBRobotikacs5Volitelnýano
SSPStochastické procesycs4Volitelnýano
SRIStrategické řízení informačních systémůcs5Volitelnýano
TAMTvorba aplikací pro mobilní zařízenícs5Volitelnýano
VYPeVýstavba překladačů (v angličtině)en5Volitelnýano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelnýano
Libovolný ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AGSAgentní a multiagentní systémycs5Povinně volitelnýano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelnýano
EVOAplikované evoluční algoritmycs5Povinně volitelnýano
ARCArchitektura a programování paralelních systémůcs5Povinně volitelnýano
FIKFilozofie a kulturacs, en3Povinně volitelnýano
KKOKódování a komprese datcs5Povinně volitelnýano
HKOKomunikační dovednostics, en3Povinně volitelnýano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelnýano
KRYKryptografiecs5Povinně volitelnýano
NAVNávrh externích adaptérů a vestavěných systémůcs5Povinně volitelnýano
NSBNávrh, správa a bezpečnostcs5Povinně volitelnýano
POSPokročilé operační systémycs5Povinně volitelnýano
HPRPrezentační dovednostics3Povinně volitelnýano
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokolycs, en5Povinně volitelnýano
HPOPsychologie osobnostics3Povinně volitelnýano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelnýano
SNTSimulační nástroje a technikycs5Povinně volitelnýano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelnýano
ZREZpracování řečových signálůcs, en5Povinně volitelnýano
DJADynamické jazykycs5Volitelnýano
FLPFunkcionální a logické programovánícs5Volitelnýano
FYOFyzikální optikacs, en5Volitelnýano
GISGeografické informační systémycs5Volitelnýano
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javěcs, en5Volitelnýano
WAPInternetové aplikacecs5Volitelnýano
LOGLogikacs5Volitelnýano
MPRManagement projektůcs5Volitelnýano
MEKManažerská ekonomikacs5Volitelnýano
MARMarketingcs5Volitelnýano
MULMultimédiacs, en5Volitelnýano
PESPetriho sítěcs5Volitelnýano
PISPokročilé informační systémycs5Volitelnýano
MZSPokročilé zpracování signálůcs6Volitelnýano
PMAProjektový manažercs5Volitelnýano
C2PSítě s vícevrstevným přepínáním (SWITCH)cs5Volitelnýano
SLOSložitostcs5Volitelnýano
SVSeSpecifikace vestavěných systémů (v angličtině)en5Volitelnýano
STMStrategický managementcs5Volitelnýano
SPPSystémy odolné proti poruchámcs5Volitelnýano
VIZVizualizace a CADcs5Volitelnýano
VGEVýpočetní geometriecs, en5Volitelnýano
VNVVysoce náročné výpočtycs, en5Volitelnýano
VINVýtvarná informatikacs5Volitelnýano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelnýano
ZPOZpracování obrazucs, en5Volitelnýano