Detail oboru

Bioinformatika a biocomputing

FITZkratka: MBIAk. rok: 2014/2015

Program: Informační technologie

Délka studia: 2 roky

Profil

Studenti se seznámí s pokročilými algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Studenti se naučí tyto algoritmy jednak aplikovat pro řešení konkrétních problémů z praxe, ale i vytvářet nové efektivní algoritmy. Seznámí se s databázemi biologických dat, které se standardně používají. Studenti porozumí konceptům molekulární genetiky, budou připraveni komunikovat s biology a vytvářet s nimi pracovní týmy. Znalosti získané studiem biologických systémů budou schopni uplatnit při návrhu a realizaci nových výpočetních systémů inspirovaných biologickými procesy. Získají znalosti z různých oblastí počítání podle přírody (natural computing), mezi které patří evoluční návrh, vyvíjející se systémy, DNA počítání, fuzzy systémy, neuronové sítě, nekonvenční počítače apod. Budou umět integrovat tyto biologií inspirované techniky do stávajících výpočetních systémů a tím vylepšit některé jejich parametry.

Klíčové výsledky učení

Student oboru získá hlubší teoretické znalosti a dovednosti v oboru bioinformatiky a počítání podle přírody a získá tak potřebné znalostní a dovednostní základ pro analýzu, návrh a ověřování problémů biologických databází, algoritmů pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky, využití technik počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení.

Profesní profil absolventů s příklady


  • Absolventi mají pokročilé znalosti bioinformatiky, počítání podle přírody (natural computing) a orientují se v principech molekulární genetiky. Dovedou využívat biologické databáze, používat, vytvářet a akcelerovat algoritmy pro zpracování, analýzu a prezentaci biologických dat pocházejících zejména z oblastí genomiky a proteomiky. Dokáží aplikovat techniky počítání podle přírody (evoluční algoritmy, neuronové sítě, fuzzy systémy atd.) při návrhu, optimalizaci a implementaci výpočetních zařízení a tím dosáhnout vylepšení jejich parametrů. 
  • Absolventi mají hluboké teoretické a praktické znalosti v oboru informačních technologií, a to zejména v oblastech pokročilých databázových systémů, teoretické informatiky, hardware/software codesignu a paralelních a distribuovaných algoritmů.
  • Absolventi jsou připraveni pro projektování, provoz a správu bioinformatických počítačových systémů. Jsou schopni aplikovat biologií inspirované metody při návrhu i realizaci výpočetních systémů. Jsou schopni navrhnout a provést experiment, analyzovat a interpretovat data, pracovat samostatně i v týmu, prezentovat výsledky a dále se vzdělávat jak v informatice tak i biologii. 
  • Možné uplatnění je v profesích jako projektant nebo správce bioinformatických počítačových systémů používaných v biotechnologických firmách, zdravotnictví, kriminalistice apod. Absolvent oboru dále uplatní získané vzdělání ve vývojových a výzkumných odděleních firem a institucí zabývajících se vývojem bionformatických systémů nebo výpočetních systémů, které využívají prvky moderní umělé inteligence.

Garant


Struktura předmětů s uvedením ECTS kreditů (studijní plán)

1. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIOBiometrické systémycs, en5Povinnýzá,zkP - 39 / L - 6 / PR - 7ano
MATMatematické struktury v informaticecs, en5Povinnýzkano
MOGMolekulární genetikacs3Povinnýzkano
PDBPokročilé databázové systémycs, en5Povinnýzá,zkano
TINTeoretická informatikacs5Povinnýzá,zkano
STISeminář teoretické informatikycs2Volitelnýano
1. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
BIFBioinformatikacs5PovinnýzkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
BINBiologií inspirované počítačecs5PovinnýzkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
PRLParalelní a distribuované algoritmycs5Povinnýzá,zkano
2. ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
PBIPokročilá bioinformatikacs4Povinnýzkano
SEPSemestrální projektcs, en5Povinnýklano
SFCSoft Computingcs5Povinnýzá,zkano
THETeorie hercs4Povinnýzá,zkano
ZZNZískávání znalostí z databázícs5Povinnýzá,zkano
2. ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
DIPDiplomový projektcs, en13PovinnýPR - 169ano
Libovolný ročník, zimní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AEUAngličtina pro Evropucs3Povinně volitelnýzá,zkCOZ - 26ano
FCEAngličtina: příprava na zkoušku FCEcs3Povinně volitelnýano
BISBezpečnost informačních systémůcs5Povinně volitelnýzkP - 39 / PR - 13ano
FITDějiny a filozofie technikycs3Povinně volitelnýano
HSCHardware/Software Codesigncs, en5Povinně volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
SINInteligentní systémycs5Povinně volitelnýzkano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
PCSPokročilé číslicové systémycs5Povinně volitelnýzkano
PRMPrávní minimumcs, en3Povinně volitelnýano
HPOPsychologie osobnostics3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
AISAnalýza a návrh informačních systémůcs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
ACHArchitektura procesorůcs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 26ano
BMSBezdrátové a mobilní sítěcs5VolitelnýzkP - 39 / PR - 13ano
EIPEkonomie informačních produktůcs5VolitelnýzkP - 26 / COZ - 6 / PR - 20ano
FAVFormální analýza a verifikacecs5Volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 13ano
GZNGrafická a zvuková rozhraní a normycs5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
GUXGrafická uživatelská rozhraní v X Windowcs5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
GMUGrafické a multimediální procesorycs5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
GALGrafové algoritmycs, en5VolitelnýzkP - 39 / PR - 13ano
SENInteligentní senzorycs5Volitelnýzá,zkano
KRGKreativní grafikacs4Volitelnýklano
MOBModelování biologických systémůcs4Volitelnýzá,zkano
OPMOptimalizacecs4Volitelnýzá,zkano
PGRPočítačová grafikacs, en5Volitelnýzkano
POVPočítačové viděnícs5Volitelnýzkano
PGPPokročilá počítačová grafikacs5Volitelnýzkano
PKSPokročilé komunikační systémycs5Volitelnýzá,zkano
PDIProstředí distribuovaných aplikacícs, en5Volitelnýzkano
ROSReal-time operační systémycs5Volitelnýzkano
ROBRobotikacs5Volitelnýzkano
SSPStochastické procesycs4Volitelnýzá,zkano
SRIStrategické řízení informačních systémůcs5Volitelnýzkano
TAMTvorba aplikací pro mobilní zařízenícs5Volitelnýzkano
VYPeVýstavba překladačů (v angličtině)en5Volitelnýzkano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelnýano
Libovolný ročník, letní semestr
ZkratkaNázevJ.Kr.Pov.Uk.Hod. rozsahSk.Ot.
AGSAgentní a multiagentní systémycs5Povinně volitelnýzkP - 26 / Cp - 13 / PR - 13ano
AEUAngličtina pro Evropucs, en3Povinně volitelnýzá,zkCOZ - 26ano
EVOAplikované evoluční algoritmycs5Povinně volitelnýzkP - 26 / Cp - 8 / PR - 18ano
ARCArchitektura a programování paralelních systémůcs5Povinně volitelnýzá,zkP - 39 / PR - 26ano
FIKFilozofie a kulturacs, en3Povinně volitelnýano
KKOKódování a komprese datcs5Povinně volitelnýzá,zkano
HKOKomunikační dovednostics, en3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
HKAKonflikty a asertivitacs3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
KRYKryptografiecs5Povinně volitelnýzá,zkano
NAVNávrh externích adaptérů a vestavěných systémůcs5Povinně volitelnýzkano
NSBNávrh, správa a bezpečnostcs5Povinně volitelnýzá,zkano
POSPokročilé operační systémycs5Povinně volitelnýzkano
HPRPrezentační dovednostics3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
PDSPřenos dat, počítačové sítě a protokolycs, en5Povinně volitelnýzkano
HPOPsychologie osobnostics3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
RETRétorikacs, en3Povinně volitelnýano
SNTSimulační nástroje a technikycs5Povinně volitelnýzá,zkano
HVRVedení a řízení lidícs, en3Povinně volitelnýCOZ - 26ano
ZREZpracování řečových signálůcs, en5Povinně volitelnýzkano
DJADynamické jazykycs5VolitelnýzkP - 26 / Cp - 6 / PR - 20ano
FLPFunkcionální a logické programovánícs5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 12 / PR - 14ano
FYOFyzikální optikacs, en5VolitelnýzkP - 26 / COZ - 13 / PR - 13ano
GISGeografické informační systémycs5Volitelnýzá,zkP - 26 / Cp - 10 / PR - 16ano
GJAGrafická uživatelská rozhraní v Javěcs, en5VolitelnýzkP - 26 / PR - 26ano
WAPInternetové aplikacecs5Volitelnýzá,zkano
LOGLogikacs5Volitelnýzá,zkano
MPRManagement projektůcs5Volitelnýzá,zkano
MEKManažerská ekonomikacs5Volitelnýzá,zkano
MARMarketingcs5Volitelnýzá,zkano
MULMultimédiacs, en5Volitelnýzkano
PESPetriho sítěcs5Volitelnýzkano
PISPokročilé informační systémycs5Volitelnýzá,zkano
MZSPokročilé zpracování signálůcs6Volitelnýzá,zkano
PMAProjektový manažercs5Volitelnýklano
C2PSítě s vícevrstevným přepínáním (SWITCH)cs5VolitelnýklL - 52ano
SLOSložitostcs5Volitelnýzkano
SVSeSpecifikace vestavěných systémů (v angličtině)en5Volitelnýzkano
STMStrategický managementcs5Volitelnýzá,zkano
SPPSystémy odolné proti poruchámcs5Volitelnýzá,zkano
VIZVizualizace a CADcs5Volitelnýklano
VGEVýpočetní geometriecs, en5Volitelnýzkano
VNVVysoce náročné výpočtycs, en5Volitelnýzkano
VINVýtvarná informatikacs5Volitelnýzkano
ZPXZahraniční odborná praxeen5Volitelnýano
ZPOZpracování obrazucs, en5Volitelnýzkano